More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1767 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  100 
 
 		 453 aa  932    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  64.33 
 
 		 448 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  61.94 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  61.97 
 
 		 449 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  61.74 
 
 		 449 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  51.89 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  54.09 
 
 		 445 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  55.58 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  50.91 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  53.39 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  55.23 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  54.77 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  50.46 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  50.79 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  51.24 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  50.9 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  51.59 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  52.39 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  50.45 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  52.01 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.5 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  39.23 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  39 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  39.55 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  38.55 
 
 		 444 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  39.18 
 
 		 440 aa  296  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  38.24 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  39.63 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  39.23 
 
 		 469 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  38.32 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  38.32 
 
 		 444 aa  292  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  38.46 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  37.61 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  39.37 
 
 		 445 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  39.26 
 
 		 464 aa  289  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  40.58 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  39.63 
 
 		 442 aa  289  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  39.91 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  38.55 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  38.55 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  38.64 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  39.14 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  39.4 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  39.1 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  39.37 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  37.39 
 
 		 440 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  40.72 
 
 		 442 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  39.91 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  39.91 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  38.13 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  40.36 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  37.97 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  37.97 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  37 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  37.97 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  35.97 
 
 		 445 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  37.03 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  36.59 
 
 		 445 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  37.26 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  36.47 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.3 
 
 		 418 aa  225  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  32.16 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  30.43 
 
 		 405 aa  223  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  32.22 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  32.58 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  29.49 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.18 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  29.26 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  34.52 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  29.95 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  29.72 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  29.72 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  29.72 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.71 
 
 		 488 aa  206  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.78 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  34.98 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  30.41 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  30.41 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  30.41 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  30.41 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.04 
 
 		 494 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  33.25 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  30.96 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.1 
 
 		 424 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.25 
 
 		 449 aa  193  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.67 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  30.88 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  31.07 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.7 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.29 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  31.41 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  30.28 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  32.64 
 
 		 429 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  30.66 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.23 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  29 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  28.64 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  28.41 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  27.96 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>