More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1753 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  72.13 
 
 		 444 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  72.36 
 
 		 444 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  71.69 
 
 		 440 aa  651    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  70.14 
 
 		 442 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  84.65 
 
 		 445 aa  744    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  84.42 
 
 		 445 aa  757    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  73.3 
 
 		 444 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  71.62 
 
 		 444 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  71.4 
 
 		 444 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  69.91 
 
 		 464 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  72.13 
 
 		 444 aa  670    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  71.27 
 
 		 446 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  71.95 
 
 		 442 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  69.46 
 
 		 444 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  84.46 
 
 		 446 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  72.17 
 
 		 444 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  69 
 
 		 441 aa  653    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  91.01 
 
 		 446 aa  830    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  100 
 
 		 446 aa  896    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  65.46 
 
 		 445 aa  607  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  62.75 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  63.76 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  63.12 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  59.86 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  56.98 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  57.7 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  57.7 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  58.22 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  57.01 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.26 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  48.64 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  52.64 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  42.76 
 
 		 437 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  42.53 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.55 
 
 		 442 aa  342  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  42.76 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  43.66 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  43.66 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  43.56 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  42.6 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  42.22 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  40.63 
 
 		 440 aa  313  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.76 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  37.44 
 
 		 446 aa  296  7e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  39.4 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  36.05 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  37.39 
 
 		 445 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  34.08 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  35.43 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  37.39 
 
 		 445 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  34.68 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  38.62 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  37.56 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  37.11 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  34.73 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  36.91 
 
 		 448 aa  257  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  38.89 
 
 		 432 aa  256  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  37.84 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  36.24 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  33.33 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  34.04 
 
 		 444 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  37.16 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.49 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  34.47 
 
 		 449 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  35.14 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.71 
 
 		 494 aa  239  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  36.22 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.96 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.43 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.55 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  34 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  31.78 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.98 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.83 
 
 		 488 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.24 
 
 		 440 aa  216  9e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  35.54 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.04 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.58 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  34.73 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.42 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  37.08 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  32.01 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.79 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  30.18 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  30.93 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.54 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31.55 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  31.55 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  31.55 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  31.55 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  31.66 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  31.66 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  31.66 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.66 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.36 
 
 		 448 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  31.32 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  31.55 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  31.82 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.2 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  31.55 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>