More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4357 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  100 
 
 		 444 aa  898    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  71.27 
 
 		 445 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  61.76 
 
 		 445 aa  571  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  62.9 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  63.12 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  63.35 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  62.9 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  62.22 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  61.76 
 
 		 442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  63.12 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  62.9 
 
 		 444 aa  558  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  61.99 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  61.09 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  62.22 
 
 		 444 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  64.25 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  60.63 
 
 		 444 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  61.09 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  62.19 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  61.31 
 
 		 446 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  62.22 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  60.41 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  60.18 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  58.31 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  58.62 
 
 		 441 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  57.53 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  55.84 
 
 		 456 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  55.84 
 
 		 456 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  55.61 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  56.06 
 
 		 458 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  52.87 
 
 		 439 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  50.11 
 
 		 439 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  47.96 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  41.1 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  42.35 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  42.73 
 
 		 443 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  42.73 
 
 		 443 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  42.12 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  39.5 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  40 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  39.19 
 
 		 440 aa  320  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  40.27 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.36 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.01 
 
 		 442 aa  296  7e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  37.26 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  37.58 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  33.78 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  33.56 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  32.87 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  32.8 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  33.41 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  32.41 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  35.15 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  35.75 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  31.01 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  35.35 
 
 		 445 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  33.63 
 
 		 445 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  33.18 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  33.11 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  35.14 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  34.38 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  36.32 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  34.15 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  31.78 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.41 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  32.71 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.14 
 
 		 494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.2 
 
 		 418 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.33 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  36.47 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.27 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  36.84 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.51 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  32.39 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.21 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.1 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  31.07 
 
 		 405 aa  200  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.15 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.82 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.67 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  33.41 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.31 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.82 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  33.41 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  33.41 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  32.96 
 
 		 453 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  34.33 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.54 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.88 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  32.51 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.76 
 
 		 466 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  31.66 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  31.01 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  32.28 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.26 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  30.51 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  30.51 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  29.65 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  30.21 
 
 		 428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  30.21 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  31.04 
 
 		 473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>