More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2177 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  76.2 
 
 
437 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  74.94 
 
 
439 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  70.56 
 
 
469 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  73.12 
 
 
440 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  74.49 
 
 
439 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  100 
 
 
443 aa  910    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  75.97 
 
 
437 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  67.57 
 
 
442 aa  589  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  57.01 
 
 
443 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  57.01 
 
 
443 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 
442 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  43.57 
 
 
453 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  41.91 
 
 
446 aa  345  8e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  43.47 
 
 
445 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  44.8 
 
 
444 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  42.18 
 
 
444 aa  339  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  41.57 
 
 
445 aa  338  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  41.8 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  41.8 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  42.82 
 
 
456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  42.82 
 
 
456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  42.82 
 
 
456 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  42.15 
 
 
444 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  44.86 
 
 
441 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  43.28 
 
 
458 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  41.94 
 
 
453 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  43.94 
 
 
440 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  44.06 
 
 
444 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  41.74 
 
 
442 aa  332  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  41.26 
 
 
464 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  43.56 
 
 
446 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  40.99 
 
 
444 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  40.81 
 
 
444 aa  329  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  44.06 
 
 
445 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  41.57 
 
 
446 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  42.26 
 
 
445 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  40.67 
 
 
443 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  39.69 
 
 
444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  40.09 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  40 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  41.63 
 
 
465 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  40.95 
 
 
444 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  38.93 
 
 
444 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  41.08 
 
 
445 aa  317  3e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  39.64 
 
 
448 aa  316  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  40.36 
 
 
445 aa  316  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  41.06 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  40 
 
 
446 aa  299  6e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  37.61 
 
 
453 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  37.05 
 
 
442 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  38.98 
 
 
445 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  37.44 
 
 
445 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  37.81 
 
 
445 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  37.21 
 
 
444 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  36.26 
 
 
444 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  37.19 
 
 
448 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  36.44 
 
 
449 aa  276  7e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  35.62 
 
 
439 aa  272  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  36.87 
 
 
449 aa  270  5e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  37 
 
 
446 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  36.32 
 
 
449 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  36.32 
 
 
449 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 
418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  34.93 
 
 
439 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.79 
 
 
488 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  36.77 
 
 
432 aa  229  8e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  34.09 
 
 
468 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  33.26 
 
 
455 aa  226  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  34.59 
 
 
405 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  35.38 
 
 
423 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.6 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  36.23 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.62 
 
 
426 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.78 
 
 
494 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.46 
 
 
418 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  31.06 
 
 
418 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.99 
 
 
418 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.41 
 
 
431 aa  204  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.86 
 
 
399 aa  203  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31.49 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  31.49 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  31.03 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  31.26 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.88 
 
 
420 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.8 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  31.15 
 
 
428 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  30.21 
 
 
425 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  31.18 
 
 
425 aa  186  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  30.21 
 
 
425 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  29.91 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  32.2 
 
 
430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  31.53 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  29.6 
 
 
425 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>