More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1089 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  100 
 
 
425 aa  865    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  50.94 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  51.52 
 
 
430 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  51.52 
 
 
425 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  51.52 
 
 
425 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  49.29 
 
 
425 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  49.41 
 
 
427 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  48.59 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  48.36 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  48.59 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  48.59 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  48.36 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  48.36 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  48.59 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  48.36 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  49.53 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  48.24 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  48.12 
 
 
428 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  48.36 
 
 
428 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  46.96 
 
 
428 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.33 
 
 
429 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 
431 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.52 
 
 
426 aa  319  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  42.62 
 
 
431 aa  316  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.86 
 
 
436 aa  314  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.8 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.27 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.78 
 
 
424 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  42.66 
 
 
431 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 
424 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.02 
 
 
425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.55 
 
 
425 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.78 
 
 
434 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.36 
 
 
425 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.82 
 
 
425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  41.48 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.08 
 
 
441 aa  306  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.29 
 
 
438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.08 
 
 
428 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  40.28 
 
 
426 aa  298  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0660  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.76 
 
 
398 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  40.19 
 
 
431 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 
425 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  39.11 
 
 
425 aa  293  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.25 
 
 
432 aa  292  8e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  38.73 
 
 
425 aa  292  9e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  40.49 
 
 
446 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0502  dihydroorotase  38.64 
 
 
417 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.12 
 
 
430 aa  290  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.91 
 
 
429 aa  289  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  40.47 
 
 
423 aa  288  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  38.95 
 
 
426 aa  286  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.02 
 
 
430 aa  285  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.86 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 
427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  37.78 
 
 
429 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.72 
 
 
433 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  39.06 
 
 
459 aa  281  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  38.3 
 
 
423 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  41.84 
 
 
422 aa  280  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37.18 
 
 
436 aa  279  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.16 
 
 
428 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.38 
 
 
427 aa  278  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.19 
 
 
448 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.85 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  40.98 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.12 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.36 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.98 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.77 
 
 
447 aa  272  8.000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.05 
 
 
429 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  36.59 
 
 
446 aa  272  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.93 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  37.09 
 
 
447 aa  268  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1200  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.41 
 
 
399 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0128604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1385  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.64 
 
 
399 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.888819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.14 
 
 
439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  38.44 
 
 
430 aa  266  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  36.96 
 
 
439 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.2 
 
 
431 aa  266  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  37.59 
 
 
431 aa  266  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  37.24 
 
 
442 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  37.22 
 
 
430 aa  264  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.75 
 
 
473 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  37.84 
 
 
449 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.72 
 
 
433 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.55 
 
 
488 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  36.43 
 
 
440 aa  259  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  37.86 
 
 
432 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  37.19 
 
 
462 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  36.32 
 
 
442 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  36 
 
 
431 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.82 
 
 
439 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  35.98 
 
 
427 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 
429 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.58 
 
 
497 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  37.14 
 
 
440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>