More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4541 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  100 
 
 		 446 aa  913    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  69.44 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  69.75 
 
 		 445 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  69.53 
 
 		 445 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  53.72 
 
 		 444 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  55.23 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  55.58 
 
 		 453 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  55.46 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  53.57 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  52.58 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  53.23 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  52.85 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  51.38 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  48.74 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  50.23 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  46.52 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  47.68 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  48.99 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  48.1 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  47.96 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  39.19 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  38.96 
 
 		 437 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  39.91 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  39.91 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  38.69 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  39.19 
 
 		 440 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  37.56 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.53 
 
 		 469 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  38 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  38.06 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  36.49 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  37 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  36.51 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  38.79 
 
 		 442 aa  263  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  37.53 
 
 		 442 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  37.14 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.59 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.59 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  37.58 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  34.91 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  36.59 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  35.81 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  36.49 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  36.22 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  36.24 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  37.79 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  37.79 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.67 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.85 
 
 		 441 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.46 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  37.56 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  34.76 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  36.75 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  34.54 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  34.54 
 
 		 442 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  37.41 
 
 		 458 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  34 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  34.54 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  33.63 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  35.11 
 
 		 444 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  34.6 
 
 		 442 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  33.64 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  32.18 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.01 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  35.93 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  30.28 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.08 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  28.77 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  35.08 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.05 
 
 		 426 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.67 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.05 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.4 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.52 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.38 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.63 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  34.64 
 
 		 423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.86 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.02 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  30.66 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.84 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  32.21 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  30.77 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  30.77 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  28.86 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  30.02 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  31.38 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  30.68 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  30.6 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.73 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  28.87 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  28.87 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>