More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01635 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  100 
 
 		 446 aa  923    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  66.59 
 
 		 446 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  59.51 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  61.12 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  58.52 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  54.26 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  55.43 
 
 		 453 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  53.01 
 
 		 448 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  52.91 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  54.69 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  53.98 
 
 		 449 aa  484  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  53.32 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  53.76 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  52.11 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  51.59 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  51.68 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  49.89 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  49.89 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  48.55 
 
 		 445 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  48.99 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.15 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  43.05 
 
 		 437 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  43.05 
 
 		 437 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  41.35 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  40.81 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  40.95 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  40.5 
 
 		 440 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  40 
 
 		 443 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  41.32 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  41.32 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  39.49 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  39.28 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  37.44 
 
 		 446 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  38.46 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  37.76 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  39.28 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  39.28 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  39.25 
 
 		 446 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  36.77 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  39.56 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  39.56 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  38.46 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  37.65 
 
 		 442 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  39.31 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  37.99 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  35.96 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  36.74 
 
 		 465 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  40.73 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  37.56 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  38.93 
 
 		 444 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  38.82 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  36.68 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  36.71 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  35.45 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  39.9 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  35.44 
 
 		 442 aa  276  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  35.89 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  35.2 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.66 
 
 		 418 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.87 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  33.18 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  36.1 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  31.15 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.49 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  31.89 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  33.26 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  31.9 
 
 		 455 aa  224  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  32.1 
 
 		 425 aa  223  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  33.95 
 
 		 440 aa  223  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 		 457 aa  223  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  33.49 
 
 		 468 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.96 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  34.1 
 
 		 425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.71 
 
 		 418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  30.39 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.34 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  32.63 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.17 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  32.19 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  30.75 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  31.96 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  32.79 
 
 		 430 aa  204  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  32.63 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  32.19 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  33.71 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.75 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  30.2 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  31.42 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.88 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  31.88 
 
 		 425 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  31.88 
 
 		 425 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.17 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  33.03 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  32.95 
 
 		 423 aa  194  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  31.32 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.18 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.52 
 
 		 449 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.02 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.65 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>