More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1007 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  100 
 
 		 443 aa  921    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  61.88 
 
 		 446 aa  585  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  61.71 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  59.33 
 
 		 445 aa  554  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  58.26 
 
 		 448 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  61.47 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  57.6 
 
 		 445 aa  541  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  58.52 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  53.6 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  54.94 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  51.56 
 
 		 448 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  51.34 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  50.46 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  51.44 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  47.76 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  50.11 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  49.89 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  46.19 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  47.31 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  46.52 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  42.26 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  42.26 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  42.79 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  41.89 
 
 		 439 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  41.18 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  40.67 
 
 		 443 aa  322  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  40.5 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.89 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  40.79 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  40.79 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  36.88 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  36.28 
 
 		 446 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  36.22 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  37.13 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  37.33 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  36.45 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  38.52 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  36.9 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  36.9 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  36.14 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  36.53 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  36.45 
 
 		 444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  36.94 
 
 		 456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  36.94 
 
 		 456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  36.71 
 
 		 456 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  36.73 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  36.05 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  35.6 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  35.37 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  36.45 
 
 		 444 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  36.59 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  36.41 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.77 
 
 		 446 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  35.99 
 
 		 464 aa  272  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  36.95 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  33.87 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  35.36 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  34.55 
 
 		 445 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.8 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.11 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  32.77 
 
 		 439 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  31.92 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  33.75 
 
 		 440 aa  226  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  32.68 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.25 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  31.38 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  31.84 
 
 		 439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  32.35 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.44 
 
 		 494 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  32.79 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  28.86 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  32.48 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.77 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.15 
 
 		 420 aa  202  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.13 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  31.82 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  32.78 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  28.8 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  30.61 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  28.51 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.17 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.21 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  31.81 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  30.96 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  33 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  31.52 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  29.09 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.12 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  29.91 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.7 
 
 		 425 aa  172  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  30.96 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.77 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  30.19 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  31.09 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.35 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  30.56 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.84 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.25 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>