More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0848 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
421 aa  859    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.32 
 
 
422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.55 
 
 
412 aa  455  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.37 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  47.62 
 
 
421 aa  340  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  37.68 
 
 
468 aa  245  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.9 
 
 
488 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  36.77 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.23 
 
 
440 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  35.41 
 
 
455 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  33.97 
 
 
423 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  35.86 
 
 
445 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.93 
 
 
399 aa  186  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  33.58 
 
 
453 aa  186  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.6 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  35.63 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  35.08 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  33.25 
 
 
442 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  34.87 
 
 
445 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  35.59 
 
 
446 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.78 
 
 
444 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  36.15 
 
 
444 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  32.44 
 
 
445 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.06 
 
 
444 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.06 
 
 
444 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  32.43 
 
 
440 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.02 
 
 
445 aa  176  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  35.48 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  33.16 
 
 
444 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  34.07 
 
 
442 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  32.7 
 
 
441 aa  173  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  34.76 
 
 
441 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  33.41 
 
 
444 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.34 
 
 
418 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  32.71 
 
 
444 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  33.99 
 
 
464 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.9 
 
 
418 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  33.25 
 
 
443 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  33.25 
 
 
443 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  31.35 
 
 
443 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  31.35 
 
 
437 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  31.35 
 
 
437 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  31.5 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  31.63 
 
 
439 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.1 
 
 
431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.83 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  32.39 
 
 
442 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  31.96 
 
 
446 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  33.91 
 
 
458 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  32.63 
 
 
456 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  31.98 
 
 
443 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  30.56 
 
 
446 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  32.65 
 
 
465 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.37 
 
 
426 aa  156  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  32.41 
 
 
456 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  32.41 
 
 
456 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31.64 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  31.14 
 
 
439 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.03 
 
 
418 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  28.82 
 
 
423 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  31.65 
 
 
459 aa  152  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  31.49 
 
 
469 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  34.16 
 
 
425 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  30.38 
 
 
440 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  30.07 
 
 
459 aa  149  6e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  30.9 
 
 
439 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.76 
 
 
442 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  32.4 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  29.13 
 
 
445 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  30.1 
 
 
428 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  30.12 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  30.12 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  30.12 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  29.72 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  28.61 
 
 
454 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.33 
 
 
438 aa  146  8.000000000000001e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1675  amidohydrolase  26.58 
 
 
384 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.717756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  30.12 
 
 
428 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  30.12 
 
 
428 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  29.06 
 
 
446 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.72 
 
 
429 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  30.12 
 
 
428 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.61 
 
 
431 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.31 
 
 
431 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  32.05 
 
 
442 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.59 
 
 
494 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  30.79 
 
 
430 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  29.47 
 
 
428 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  32.15 
 
 
431 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  32.15 
 
 
431 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  32.15 
 
 
431 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.68 
 
 
429 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  29.34 
 
 
428 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  29.32 
 
 
447 aa  142  9e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  31.34 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  29.85 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  32.43 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  31.86 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.22 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1961  dihydroorotase  27.67 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>