More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1113 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  100 
 
 
432 aa  878    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  44.07 
 
 
468 aa  359  6e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  44.07 
 
 
455 aa  353  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  42.53 
 
 
488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  42.72 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  43.08 
 
 
423 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  39.86 
 
 
440 aa  277  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  38.04 
 
 
444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  38.5 
 
 
444 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  38.5 
 
 
444 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.6 
 
 
399 aa  266  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  39 
 
 
442 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  39.72 
 
 
444 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  39.04 
 
 
444 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  38.41 
 
 
444 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  39.58 
 
 
441 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  39.24 
 
 
446 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  38.89 
 
 
446 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  38.5 
 
 
443 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  38.5 
 
 
443 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  38.05 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  37.36 
 
 
441 aa  254  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  38.5 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  39.08 
 
 
464 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  37.5 
 
 
445 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  38.66 
 
 
456 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  38.66 
 
 
456 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  38.5 
 
 
456 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  37.58 
 
 
444 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  37.5 
 
 
445 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  39.23 
 
 
444 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  37.01 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  37.93 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.77 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.44 
 
 
422 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  39.05 
 
 
458 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  38.53 
 
 
465 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  35 
 
 
439 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  35 
 
 
437 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  35 
 
 
437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  37.53 
 
 
440 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 
431 aa  235  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  35.42 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 
442 aa  233  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  36.04 
 
 
439 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  36.32 
 
 
444 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.03 
 
 
494 aa  229  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  36.77 
 
 
443 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  35.78 
 
 
442 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  34.62 
 
 
445 aa  227  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.95 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  35.43 
 
 
469 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  33.96 
 
 
425 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  32.54 
 
 
418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.81 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 
426 aa  223  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  34.79 
 
 
428 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  38.6 
 
 
421 aa  222  8e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  35.02 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  35.02 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  35.02 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  35.09 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  35.25 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.86 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  35.02 
 
 
428 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  35.02 
 
 
428 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  35.02 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  34.79 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.37 
 
 
418 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  34.06 
 
 
464 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  34.79 
 
 
428 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.33 
 
 
425 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.13 
 
 
418 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  34.56 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.57 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  30.48 
 
 
446 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  31.38 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  34.02 
 
 
428 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.48 
 
 
454 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  32.87 
 
 
445 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.53 
 
 
420 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  34.72 
 
 
429 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  34.88 
 
 
427 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  31.69 
 
 
445 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  33.41 
 
 
426 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  33.7 
 
 
451 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  33.95 
 
 
449 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  30.95 
 
 
453 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  30.95 
 
 
453 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  30.95 
 
 
453 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  30.95 
 
 
453 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.71 
 
 
425 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.89 
 
 
427 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  32.2 
 
 
430 aa  206  7e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  31.64 
 
 
453 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  32.78 
 
 
453 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.5 
 
 
429 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  30.3 
 
 
448 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.94 
 
 
425 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  31.87 
 
 
453 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>