More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0757 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  100 
 
 
455 aa  934    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  63.92 
 
 
468 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  44.97 
 
 
432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  40.04 
 
 
440 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  41.65 
 
 
423 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  39.44 
 
 
488 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  37.73 
 
 
439 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.95 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  39 
 
 
418 aa  249  9e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  36.49 
 
 
444 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  36.1 
 
 
464 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  34.95 
 
 
456 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  34.95 
 
 
456 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  34.85 
 
 
442 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  34.95 
 
 
456 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  35.27 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  34.23 
 
 
437 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  36.73 
 
 
444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  34.23 
 
 
437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  36.82 
 
 
444 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.76 
 
 
418 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.24 
 
 
444 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  34.02 
 
 
444 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  36.26 
 
 
444 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  34.97 
 
 
444 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  38.04 
 
 
418 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  34.95 
 
 
443 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.7 
 
 
446 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.01 
 
 
422 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  34.95 
 
 
443 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.53 
 
 
441 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  37.28 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  33.33 
 
 
469 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  34.35 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.13 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.16 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  35.34 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  34.4 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.92 
 
 
446 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  34.26 
 
 
465 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.21 
 
 
426 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  35.7 
 
 
445 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  34.29 
 
 
442 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.41 
 
 
421 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.17 
 
 
420 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.55 
 
 
446 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  33.71 
 
 
443 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.9 
 
 
442 aa  230  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.89 
 
 
444 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  33.81 
 
 
441 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.48 
 
 
445 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  33.56 
 
 
446 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  36.69 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  34.32 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  32.59 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  34.21 
 
 
439 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  34.33 
 
 
444 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.27 
 
 
412 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  33.26 
 
 
445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  33.62 
 
 
464 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  33.19 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  32.3 
 
 
446 aa  212  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  31.67 
 
 
446 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  31.47 
 
 
448 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  30.97 
 
 
446 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  30.42 
 
 
449 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  31.83 
 
 
445 aa  206  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.73 
 
 
452 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  31.34 
 
 
453 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  32.18 
 
 
442 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  30.43 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  30.85 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  31.07 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  31.38 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  32.7 
 
 
443 aa  196  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  31.29 
 
 
448 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.13 
 
 
418 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  29.65 
 
 
445 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  31.69 
 
 
453 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  31.69 
 
 
453 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  31.69 
 
 
453 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.69 
 
 
453 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.71 
 
 
428 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  29.8 
 
 
445 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.68 
 
 
494 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  31.34 
 
 
457 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  31.28 
 
 
449 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  30.58 
 
 
449 aa  188  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31.4 
 
 
427 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  32.56 
 
 
484 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30.55 
 
 
453 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  30.55 
 
 
453 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  30.64 
 
 
444 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.55 
 
 
453 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.55 
 
 
453 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  28.98 
 
 
445 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.71 
 
 
428 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  31.92 
 
 
484 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  30.55 
 
 
453 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.55 
 
 
453 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>