More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0585 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  92.11 
 
 
418 aa  776    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  77.83 
 
 
420 aa  656    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  88.52 
 
 
418 aa  752    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  100 
 
 
418 aa  842    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.14 
 
 
426 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  36.28 
 
 
468 aa  243  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  33.49 
 
 
443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  33.49 
 
 
443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  37.8 
 
 
455 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  33.81 
 
 
445 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.76 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.76 
 
 
444 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  33.49 
 
 
445 aa  236  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  33.18 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.78 
 
 
446 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  33.96 
 
 
444 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  33.89 
 
 
441 aa  229  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.86 
 
 
444 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  32.55 
 
 
437 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  32.55 
 
 
437 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.63 
 
 
446 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.24 
 
 
446 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  33.81 
 
 
444 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  32.15 
 
 
440 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  32.62 
 
 
444 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.33 
 
 
464 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.54 
 
 
432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.08 
 
 
442 aa  223  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  32.86 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.78 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  32.48 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  31.92 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  33.8 
 
 
428 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.01 
 
 
453 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.04 
 
 
442 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  32.16 
 
 
445 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.64 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  33.07 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.87 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 
418 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  32.41 
 
 
428 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  32.41 
 
 
428 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  32.41 
 
 
428 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.41 
 
 
428 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.41 
 
 
428 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.41 
 
 
428 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  32.18 
 
 
428 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  32.79 
 
 
425 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  32.18 
 
 
428 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  33.02 
 
 
439 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  30.88 
 
 
465 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  32.79 
 
 
443 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  33.26 
 
 
425 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  33.26 
 
 
425 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  33.26 
 
 
446 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  30.99 
 
 
442 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  31.06 
 
 
443 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.18 
 
 
425 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  29.51 
 
 
444 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.51 
 
 
429 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.53 
 
 
431 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.44 
 
 
456 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.44 
 
 
456 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  33.03 
 
 
446 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  28.77 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  28.9 
 
 
445 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.58 
 
 
442 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  33.64 
 
 
431 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  31.9 
 
 
440 aa  199  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.44 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  31 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.4 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  30.17 
 
 
458 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  29.25 
 
 
439 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.26 
 
 
425 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.79 
 
 
426 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  32.27 
 
 
427 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  31.76 
 
 
430 aa  196  8.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  30.63 
 
 
444 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.51 
 
 
399 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  32.72 
 
 
425 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.03 
 
 
430 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  31.52 
 
 
439 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  29.21 
 
 
444 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  31.57 
 
 
428 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.02 
 
 
424 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.91 
 
 
439 aa  192  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  29.4 
 
 
439 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  33.92 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  33.11 
 
 
425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.14 
 
 
436 aa  190  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  31.4 
 
 
436 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.4 
 
 
427 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.79 
 
 
425 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.44 
 
 
428 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  29.72 
 
 
449 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  27.13 
 
 
442 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.85 
 
 
432 aa  187  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  28.7 
 
 
469 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>