More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5803 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  100 
 
 		 439 aa  876    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  68.49 
 
 		 439 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  68.95 
 
 		 442 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  53.33 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  50.57 
 
 		 445 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  51.49 
 
 		 444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  53.55 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  53.55 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  50.8 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  53.65 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  53.55 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  54.23 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  50.57 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  50.11 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  51.72 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  52.52 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  54.42 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  50.8 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  53.33 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  53.46 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  52.64 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  48.74 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  53.22 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  50.11 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  51.5 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  50.34 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  51.03 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  49.66 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  48.5 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  48.5 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  48.5 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  46.19 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.36 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  39.02 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  39.02 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  35.01 
 
 		 439 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  36.73 
 
 		 442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  35.87 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  35.87 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  36.47 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  34.93 
 
 		 443 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  35.24 
 
 		 440 aa  262  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  33.41 
 
 		 469 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  31.91 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  31.89 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  31.84 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  31.29 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  33.49 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  33.41 
 
 		 448 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  34.52 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  32.11 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  35.93 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  33.48 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  30.32 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.96 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  37.19 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  32.18 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  36.36 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  31.86 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  30.93 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.31 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.38 
 
 		 494 aa  203  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  33.26 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.94 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.51 
 
 		 488 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.63 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.26 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  28.34 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.7 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  32.6 
 
 		 449 aa  196  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  31.18 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.84 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  28.97 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  30.56 
 
 		 449 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  32.45 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  33.56 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  34.4 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.47 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  32.59 
 
 		 462 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.7 
 
 		 432 aa  182  9.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  35.02 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.37 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.74 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.33 
 
 		 453 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.33 
 
 		 453 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  33.48 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.01 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  31.6 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.76 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30.33 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  30.33 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31.63 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.52 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.09 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  30.31 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31.98 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  31.76 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.87 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  32.24 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  30.09 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>