More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4128 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  100 
 
 
462 aa  940    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.87 
 
 
494 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.94 
 
 
457 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  31.48 
 
 
466 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.91 
 
 
454 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.13 
 
 
469 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  29.41 
 
 
452 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  32.12 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  32.12 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  31.97 
 
 
461 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  31.97 
 
 
461 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  30.8 
 
 
444 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  31.97 
 
 
461 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  31.97 
 
 
461 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  31.97 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  31.76 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.39 
 
 
453 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  31.86 
 
 
448 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  30.96 
 
 
456 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  30.96 
 
 
456 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.24 
 
 
442 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  28.63 
 
 
449 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  30.43 
 
 
461 aa  190  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.6 
 
 
458 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  31.19 
 
 
441 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  28.92 
 
 
432 aa  188  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  30.4 
 
 
472 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  29.25 
 
 
463 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  30.73 
 
 
456 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  27.56 
 
 
471 aa  186  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  33.11 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  27.53 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.7 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  29.93 
 
 
444 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  29.65 
 
 
445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  28.29 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  31.5 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  31.59 
 
 
449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  28.66 
 
 
473 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  28.09 
 
 
474 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  32.84 
 
 
479 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  28.57 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  30.49 
 
 
475 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  28.51 
 
 
444 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  31.71 
 
 
439 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  28 
 
 
444 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  29.67 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  30.13 
 
 
443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  28.51 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  29.08 
 
 
446 aa  181  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  29.05 
 
 
445 aa  181  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  29.74 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  28.39 
 
 
479 aa  179  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  30.89 
 
 
437 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  30.89 
 
 
437 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  29.02 
 
 
440 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  28.76 
 
 
453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  30.29 
 
 
439 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31 
 
 
454 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  31.36 
 
 
458 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  28.76 
 
 
453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  28.76 
 
 
453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  28.76 
 
 
453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  29.42 
 
 
444 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  28.66 
 
 
474 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  32.29 
 
 
443 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  32.29 
 
 
443 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  28.79 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  27.48 
 
 
453 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  31.63 
 
 
446 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  28.78 
 
 
466 aa  173  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  27.48 
 
 
453 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  27.48 
 
 
453 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  27.25 
 
 
453 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  29.46 
 
 
442 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  27.48 
 
 
453 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  32.2 
 
 
446 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  29.69 
 
 
444 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5637  dihydropyrimidinase  29.26 
 
 
495 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  32.59 
 
 
439 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  27.25 
 
 
453 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
489 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  28.84 
 
 
479 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  29.39 
 
 
471 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  29.24 
 
 
477 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  30.42 
 
 
467 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  27.62 
 
 
440 aa  170  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  29.79 
 
 
472 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  29.32 
 
 
475 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  27.81 
 
 
456 aa  169  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  29.32 
 
 
475 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  29.02 
 
 
473 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  30.34 
 
 
477 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  29.85 
 
 
448 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  29.32 
 
 
475 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  27.99 
 
 
464 aa  168  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  30.52 
 
 
427 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  29.34 
 
 
469 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.95 
 
 
442 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  27.03 
 
 
453 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>