More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7944 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  100 
 
 		 479 aa  955    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  37.63 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  32.28 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  34.72 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  35.18 
 
 		 470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3519  dihydropyrimidinase  34.94 
 
 		 488 aa  216  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  32.3 
 
 		 474 aa  216  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4086  amidohydrolase  33.6 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  38.65 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  32.32 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  34.83 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1058  amidohydrolase  31.92 
 
 		 499 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.64 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  35.84 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  32.84 
 
 		 462 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  31.92 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.92 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  31.92 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  31.92 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  31.78 
 
 		 502 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  30.7 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  29.83 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  32.03 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.56 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.96 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30.96 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.96 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  32.03 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  30.73 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.99 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  31.26 
 
 		 489 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  30.73 
 
 		 453 aa  183  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.88 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  31.05 
 
 		 489 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  30.51 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  33.12 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  30.54 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.02 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  32 
 
 		 485 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  30.8 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  30.84 
 
 		 484 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.4 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  31.79 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  31.79 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  30.33 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  33.4 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  30.33 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  30.33 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  29.83 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  32.41 
 
 		 475 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  29.72 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  30.43 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.95 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  30.82 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  32.7 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  32.39 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  30.21 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.97 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  31.63 
 
 		 489 aa  173  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  30.21 
 
 		 461 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  30.21 
 
 		 465 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  30.21 
 
 		 461 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  30.21 
 
 		 465 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  30.21 
 
 		 461 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  30.21 
 
 		 461 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  30.7 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  30.15 
 
 		 477 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  31.42 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  31.04 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  30.88 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.28 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.37 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  29.39 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  30.8 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  30.8 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  36.04 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  28.72 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  33.92 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  31 
 
 		 483 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.48 
 
 		 453 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.39 
 
 		 449 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  31.78 
 
 		 485 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  31.78 
 
 		 485 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  31.78 
 
 		 485 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  31.36 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  29.84 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  29.74 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  30.25 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  30.83 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  31.98 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  31.74 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  31.74 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  30.36 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  32.64 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  31.74 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  30.35 
 
 		 485 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  31.35 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  30.52 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  32.63 
 
 		 479 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  31.48 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>