More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6048 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  100 
 
 		 448 aa  926    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.38 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  36.01 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.5 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  34.72 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  32.17 
 
 		 483 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  34.83 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  33.97 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  35.07 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  35.07 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  34.26 
 
 		 475 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1058  amidohydrolase  32.75 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  31.98 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  33.82 
 
 		 471 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  33.69 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  34.46 
 
 		 448 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  31.76 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  30.4 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  33.12 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  31.45 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  32.84 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.56 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  32.46 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  32.6 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  30.82 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  31.65 
 
 		 474 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  32.25 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  31.97 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.23 
 
 		 454 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  34.58 
 
 		 449 aa  196  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  32.18 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  31.87 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  32.61 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  31.56 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  32.18 
 
 		 479 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  31.97 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  32.44 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  32.4 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  33.05 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  32.83 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  30.54 
 
 		 484 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  32.83 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  32.83 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  32.83 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  32.83 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  32.01 
 
 		 474 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  32.83 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  32.83 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  30.02 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  30.74 
 
 		 485 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  30.04 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  30.53 
 
 		 485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  29.96 
 
 		 489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  29.96 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  30.72 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  30.32 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  31.51 
 
 		 479 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  30.16 
 
 		 472 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  31.25 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  30.11 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  32.4 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  30.36 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  30.91 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  31.63 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  29.18 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  29.4 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  29.67 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  29.18 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  32.25 
 
 		 467 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  31.25 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  29.65 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  29.16 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  30.2 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4086  amidohydrolase  31.19 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  29.89 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  29.89 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  29.89 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.13 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  29.89 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  31.46 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  30.11 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  27.98 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  32.41 
 
 		 483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  30.36 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30.13 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.11 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.11 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  29.4 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  29.89 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  29.37 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  27.59 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  30.45 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  29.25 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  29.85 
 
 		 462 aa  169  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  29.48 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  29.55 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  29.21 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  31.7 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  30.34 
 
 		 481 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  32.06 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>