More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4086 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4086  amidohydrolase  100 
 
 		 488 aa  997    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3519  dihydropyrimidinase  49.59 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  46.01 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  43.35 
 
 		 470 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  33.6 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  31.92 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  31.19 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  30.22 
 
 		 449 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  29.34 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  27.09 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  27.97 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  30.34 
 
 		 479 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.15 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  27.82 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  30.08 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  27.2 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  30.08 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.1 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  28.83 
 
 		 458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  29.94 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  29.92 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  31.22 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  29.57 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  29.57 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  29.57 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  29.57 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  30.48 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  29.2 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  30.28 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  29.2 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  30.52 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  29.2 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  28.83 
 
 		 484 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  30.12 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  28.99 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  29.4 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  28.99 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  28.99 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  28.99 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  31.12 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.78 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  28.63 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  29.5 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  29.17 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  28.63 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.64 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  28.01 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  28.29 
 
 		 461 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  27.56 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  28.83 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  29.23 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  25.45 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  28.27 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  25.1 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  28.54 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  30 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  28.29 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  28.54 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  26.69 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.22 
 
 		 418 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  26.94 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  29.04 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  26.94 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  28.95 
 
 		 442 aa  124  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  26.81 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  26.81 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  26.81 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  26.94 
 
 		 437 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  26.81 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  26.81 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  26.81 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  26.81 
 
 		 461 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  28.54 
 
 		 474 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  28.63 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  27.93 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  30 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  27.79 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  26.61 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  28.57 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.4 
 
 		 468 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  29.83 
 
 		 503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  27.88 
 
 		 470 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1058  amidohydrolase  27.45 
 
 		 499 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  27.01 
 
 		 502 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  27.94 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  26.5 
 
 		 475 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3013  amidohydrolase  28.54 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  27.04 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.25 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  26 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  29.08 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  27.18 
 
 		 483 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  27.18 
 
 		 501 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  27.1 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.72 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  28.31 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  26.19 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  26.19 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  26.43 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  25.74 
 
 		 418 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>