More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1785 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  100 
 
 
461 aa  933    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  68.89 
 
 
448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  59.68 
 
 
449 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.07 
 
 
454 aa  498  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  47.42 
 
 
449 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  40.46 
 
 
453 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  359  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  359  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  359  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  40 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  40.23 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  40 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  38.33 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  37.39 
 
 
448 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  41.15 
 
 
476 aa  306  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  39.58 
 
 
455 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  37.67 
 
 
452 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  40.36 
 
 
443 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  39.86 
 
 
468 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  37.73 
 
 
446 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  38.79 
 
 
449 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  39.54 
 
 
503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  40.45 
 
 
449 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  39.12 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  38.8 
 
 
435 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  38.19 
 
 
447 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  37.65 
 
 
473 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  42.13 
 
 
442 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  39.85 
 
 
450 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  40.33 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.73 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.67 
 
 
494 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  39.1 
 
 
453 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  41.51 
 
 
569 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  35.9 
 
 
480 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  38.41 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  37.7 
 
 
454 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  33.9 
 
 
506 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  35.11 
 
 
442 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  35.84 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  37.76 
 
 
465 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.33 
 
 
440 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  35.97 
 
 
446 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  32.74 
 
 
444 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  32.74 
 
 
444 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  34.66 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  34.83 
 
 
448 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  35.28 
 
 
456 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  35.28 
 
 
456 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.96 
 
 
445 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  35.27 
 
 
444 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  31.18 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  36.18 
 
 
458 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  32.82 
 
 
441 aa  222  9e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.37 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.73 
 
 
446 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  34.75 
 
 
456 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.92 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  34.15 
 
 
444 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.85 
 
 
444 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  35.12 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  35.27 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  34.82 
 
 
464 aa  213  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  35.6 
 
 
441 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  38.65 
 
 
479 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  33.71 
 
 
446 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  34.16 
 
 
445 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  33.92 
 
 
445 aa  209  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.13 
 
 
442 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  32.36 
 
 
444 aa  206  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.13 
 
 
454 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30.18 
 
 
428 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  35.61 
 
 
444 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.83 
 
 
477 aa  203  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  32.77 
 
 
481 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  33.56 
 
 
468 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  30.43 
 
 
462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.58 
 
 
444 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  29.26 
 
 
428 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  29.26 
 
 
428 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  30.61 
 
 
443 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  32.06 
 
 
445 aa  199  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  29.26 
 
 
428 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  32.07 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  29.26 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.74 
 
 
466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  29.03 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  31.07 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  33.56 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  32.67 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  32.31 
 
 
458 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  31.36 
 
 
484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  29.03 
 
 
428 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  30.2 
 
 
446 aa  196  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  29.03 
 
 
428 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  32.03 
 
 
469 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>