More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5937 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  100 
 
 		 569 aa  1106    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  65.01 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  61.44 
 
 		 455 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  59.55 
 
 		 447 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  59.55 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  58.85 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  63.09 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  61.08 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  60.45 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  62.97 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  62.14 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  62.37 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  55.36 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  56.9 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  56.49 
 
 		 442 aa  392  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  56.36 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  57.25 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  56.47 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  46.58 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  46.27 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  43.86 
 
 		 506 aa  333  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  42.2 
 
 		 481 aa  293  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  38.15 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  38.15 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  38.15 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  38.15 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  38.4 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  38.4 
 
 		 453 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  38.4 
 
 		 453 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  38.15 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  38.15 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  37.91 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  38.15 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  41.96 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  41.37 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  41.51 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.01 
 
 		 454 aa  257  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  37.43 
 
 		 449 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  38.17 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  35.29 
 
 		 452 aa  230  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  38.9 
 
 		 570 aa  207  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  39.44 
 
 		 579 aa  207  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.29 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  37.92 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.88 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  34.24 
 
 		 454 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  40.65 
 
 		 394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  35.08 
 
 		 444 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  33.24 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  32.02 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  32.47 
 
 		 449 aa  163  9e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  34.65 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  30.5 
 
 		 441 aa  160  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.07 
 
 		 427 aa  160  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  31.39 
 
 		 470 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  32.21 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  35 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  31.61 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  31.23 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  34.62 
 
 		 458 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  30.34 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.83 
 
 		 439 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  33.42 
 
 		 446 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  32.7 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  34.74 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  34.74 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.88 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  32.43 
 
 		 437 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.49 
 
 		 432 aa  156  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.84 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  30.23 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.69 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  33.01 
 
 		 463 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  30.23 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.76 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.55 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.49 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.48 
 
 		 424 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  30.65 
 
 		 449 aa  153  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  28.97 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.1 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  30.98 
 
 		 444 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  31.47 
 
 		 478 aa  151  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.44 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  30.75 
 
 		 428 aa  150  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  31.4 
 
 		 441 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  32 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3013  amidohydrolase  32.67 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  33.93 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  33.16 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.42 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  31.57 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.23 
 
 		 440 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  33.24 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  32.17 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.92 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0111  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.58 
 
 		 424 aa  147  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  31.73 
 
 		 444 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  32.99 
 
 		 431 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>