More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2841 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  100 
 
 		 450 aa  902    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  66.89 
 
 		 446 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  70.6 
 
 		 476 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  61.97 
 
 		 455 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  60.27 
 
 		 449 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  61.88 
 
 		 447 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  62.41 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  62.33 
 
 		 443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  60.18 
 
 		 503 aa  501  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  59.91 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  61 
 
 		 457 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  58.33 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  55.63 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  61.08 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  58.92 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  52.88 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  53.17 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  54.4 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  45.92 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  42.76 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  44.82 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  44.95 
 
 		 481 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  42.2 
 
 		 449 aa  312  9e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  38.34 
 
 		 453 aa  300  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  38.11 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  36.46 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  36.46 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  36.46 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  36.46 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  37.64 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  37.64 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  37.64 
 
 		 453 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  37.41 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  37.88 
 
 		 453 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  41.49 
 
 		 448 aa  295  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  34.88 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.18 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  39.85 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  34.42 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  35.65 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  37.03 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.57 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.1 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  34.98 
 
 		 570 aa  213  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  42 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  36.32 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  32 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  33.25 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  31.6 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.95 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  31.38 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.3 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  29.98 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  34.85 
 
 		 456 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  34.85 
 
 		 456 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.87 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  30.28 
 
 		 449 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.79 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  32.71 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.71 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  31.82 
 
 		 444 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.68 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  31.57 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  32.95 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  34.34 
 
 		 456 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  34.17 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  32.48 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.14 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.08 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.71 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  27.97 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  31.16 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  32.21 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  33.25 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  33.25 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  33.51 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  30.8 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  33.9 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  33.71 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  31.15 
 
 		 442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  30.06 
 
 		 467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  27.57 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  30.44 
 
 		 446 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.69 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  35.23 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  33.87 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  30.15 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  31.83 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  30.54 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  29.13 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  31.59 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.02 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  34.47 
 
 		 475 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  29.93 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  30.28 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  27.67 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.46 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  34.69 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  34.69 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  29.76 
 
 		 474 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>