More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5681 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  77.19 
 
 		 453 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  100 
 
 		 480 aa  931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  54.09 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  55.91 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  53.42 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  57.36 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  55.82 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  49.68 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  56.03 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  52.88 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  49.03 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  49.46 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  49.68 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  49.9 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  46.56 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  51.9 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  56.9 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  49.35 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  40.92 
 
 		 473 aa  360  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  52.88 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  40.59 
 
 		 506 aa  320  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  37.66 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  34.28 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  34.28 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  34.28 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  34.28 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  38.85 
 
 		 481 aa  270  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.52 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  33.04 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  32.82 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  32.82 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.82 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  32.82 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  32.6 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  32.39 
 
 		 453 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  35.9 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.38 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  33.4 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  31.75 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.95 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  38.01 
 
 		 570 aa  210  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  37.66 
 
 		 474 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.76 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  35.12 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.02 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.57 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  35.4 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  28.51 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  29.76 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.82 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  30.57 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  30 
 
 		 458 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  33.33 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  30.35 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  28.51 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  27.6 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  30.17 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.1 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  33.05 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  32.55 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  27.85 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  32.29 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  29.94 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  29.94 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  29.94 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.33 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  32.79 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  28.93 
 
 		 479 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  26.7 
 
 		 430 aa  150  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  26.88 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  28.02 
 
 		 489 aa  150  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  25.78 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.28 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  27.81 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  29.91 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  28.98 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.3 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  31.07 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  31.6 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  31.6 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  30.22 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  29 
 
 		 477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  28.98 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  30.8 
 
 		 471 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  27.03 
 
 		 459 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  29.72 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.67 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.94 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  29.72 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  28.51 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.3 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  28.74 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  29.11 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.07 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  30.94 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  30.23 
 
 		 473 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  27.02 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  31.95 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  29.93 
 
 		 465 aa  143  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.5 
 
 		 429 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>