More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3111 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00462  allantoinase  99.12 
 
 		 453 aa  934    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  93.16 
 
 		 453 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  98.68 
 
 		 453 aa  930    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  93.16 
 
 		 453 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  98.68 
 
 		 453 aa  930    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  99.12 
 
 		 453 aa  934    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  93.16 
 
 		 453 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  99.78 
 
 		 453 aa  937    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  93.16 
 
 		 453 aa  888    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  100 
 
 		 453 aa  939    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  99.34 
 
 		 453 aa  932    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  50.66 
 
 		 458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  42.92 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  41.61 
 
 		 448 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  40.46 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  40.4 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  39.55 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  38.36 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  35.84 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  39.12 
 
 		 476 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  36.51 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  34.73 
 
 		 448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  38.34 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  35.48 
 
 		 449 aa  279  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  36.24 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  37.12 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  36.76 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  35.7 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  35.32 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.35 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.2 
 
 		 494 aa  263  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  36.99 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  35.99 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  34.78 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  38.8 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  37.91 
 
 		 569 aa  252  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  33.95 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  33.4 
 
 		 506 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  35.73 
 
 		 453 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  32.6 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  32.31 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.39 
 
 		 477 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.27 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  31.48 
 
 		 481 aa  213  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.58 
 
 		 454 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  29.49 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  31.77 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.8 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.8 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  31.44 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  31.87 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.47 
 
 		 446 aa  204  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  31.97 
 
 		 460 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  33.64 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.34 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.6 
 
 		 467 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  30.49 
 
 		 469 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.14 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.95 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.6 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.42 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  31.5 
 
 		 465 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.19 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  31.28 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.34 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  32.87 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  30.54 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  30.04 
 
 		 475 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.67 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  31.35 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  30.13 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  31.62 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  31.59 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  30.13 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  30.32 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  30.13 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  30.06 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  30.28 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.13 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  30.93 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.27 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.27 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  33.26 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  29.25 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  31.03 
 
 		 488 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  29.14 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.82 
 
 		 446 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.51 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  30.99 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  30.56 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  29.45 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  29.36 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  30.37 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  28.6 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  32.55 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  30.02 
 
 		 473 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  29.68 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.76 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.77 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>