More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0775 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  100 
 
 		 458 aa  949    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  51.54 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  51.54 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  51.54 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  51.54 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  50.66 
 
 		 453 aa  471  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  50.66 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  50.44 
 
 		 453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  50.66 
 
 		 453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  50.66 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  50.44 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  50 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.6 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  40.96 
 
 		 448 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  38.33 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  37.94 
 
 		 449 aa  319  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  39.04 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  39.45 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  37 
 
 		 435 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  35.79 
 
 		 476 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  35.52 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  35.15 
 
 		 443 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  37.05 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  35.75 
 
 		 449 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  35.07 
 
 		 503 aa  255  9e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  36.2 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  34.43 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  34.09 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  35.65 
 
 		 450 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  33.93 
 
 		 447 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  33.71 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.06 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  35.14 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  33.7 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  34.32 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.26 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  36.12 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  32.73 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  31.75 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  35.19 
 
 		 453 aa  224  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  38.17 
 
 		 569 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  31.42 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  31.36 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  32.84 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  32.05 
 
 		 467 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  30.17 
 
 		 472 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  30.36 
 
 		 469 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  29.49 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  27.08 
 
 		 485 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  28.39 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  28.63 
 
 		 474 aa  179  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  27.08 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  26.87 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  31.5 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  28.76 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  31.13 
 
 		 481 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  28.01 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  28.34 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  30 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  29.27 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  27.94 
 
 		 478 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.23 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  29.93 
 
 		 444 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  29.81 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  27.49 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  30.09 
 
 		 471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  27.9 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  29.73 
 
 		 465 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  27.67 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  28.35 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  28.66 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  29.07 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  26.6 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  26.6 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  26.6 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  28.8 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  28.09 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  26.24 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  29.39 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  28.8 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  27.39 
 
 		 475 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  27.44 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.96 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  27.38 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  28.9 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  28.97 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  27.89 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  27.44 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  27.54 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  27.54 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  29.03 
 
 		 473 aa  160  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  28.07 
 
 		 445 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  28.48 
 
 		 472 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  27.67 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  26.5 
 
 		 477 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  26.79 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  28.9 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  27.66 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  27.95 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  27.68 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>