More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1798 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
444 aa  924    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  34.51 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  33.19 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.52 
 
 
457 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  31.86 
 
 
455 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.6 
 
 
454 aa  216  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.4 
 
 
494 aa  213  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  32.51 
 
 
454 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.05 
 
 
453 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.49 
 
 
446 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  32.58 
 
 
444 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  29.71 
 
 
449 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  31.61 
 
 
445 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  32.51 
 
 
444 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.29 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.35 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  30.98 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  31.56 
 
 
441 aa  201  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  32.35 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  33.48 
 
 
440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  29.76 
 
 
464 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  32.35 
 
 
444 aa  199  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  32.01 
 
 
451 aa  199  9e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  31.42 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  32.36 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  32.42 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  30.94 
 
 
445 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  31.42 
 
 
446 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  30.2 
 
 
445 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  30.41 
 
 
442 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  31.7 
 
 
444 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.54 
 
 
446 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  30.43 
 
 
464 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  30.41 
 
 
432 aa  192  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  32.3 
 
 
442 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  30.37 
 
 
465 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  31.58 
 
 
461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.41 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  32.33 
 
 
464 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  33.74 
 
 
444 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.91 
 
 
429 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  32.32 
 
 
488 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  31.58 
 
 
425 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  30.75 
 
 
474 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  30.35 
 
 
472 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  30.52 
 
 
427 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  29.14 
 
 
460 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  28.23 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  28.23 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  28.23 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  28.23 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  28.23 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  28.23 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  30.13 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  28.7 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  28.23 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  28.23 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  28.81 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  28.81 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  28.81 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  29.45 
 
 
428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  28.36 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  31.34 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  32.03 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.16 
 
 
449 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  29.05 
 
 
428 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  28.81 
 
 
428 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  28.81 
 
 
428 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  28.81 
 
 
428 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  28.27 
 
 
470 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  32.11 
 
 
423 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  28.57 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  30.14 
 
 
437 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  29.95 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  28.57 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  30.84 
 
 
442 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  29.72 
 
 
453 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  29.89 
 
 
437 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  29.95 
 
 
453 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  31.36 
 
 
444 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  29.95 
 
 
453 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  29.27 
 
 
472 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  29.33 
 
 
453 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  29.33 
 
 
453 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  29.95 
 
 
453 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  29.33 
 
 
453 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  29.72 
 
 
453 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  29.33 
 
 
453 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  30.65 
 
 
444 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  31.25 
 
 
460 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  30.58 
 
 
483 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2145  allantoinase  30.7 
 
 
465 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  28.48 
 
 
451 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  30.36 
 
 
448 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.98 
 
 
418 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  28.33 
 
 
428 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  27.9 
 
 
479 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.02 
 
 
454 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  29.72 
 
 
453 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  29.16 
 
 
471 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>