More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2145 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2145  allantoinase  100 
 
 		 465 aa  964    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5637  dihydropyrimidinase  63.48 
 
 		 495 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  31.17 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.4 
 
 		 494 aa  190  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.1 
 
 		 445 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.03 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  33.55 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  28.6 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  33.04 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  33.04 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  33.04 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.33 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  31.15 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.24 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.7 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  30.96 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  31.17 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  30.54 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  30.99 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  31.57 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  30.6 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.4 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  29.28 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  30.72 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  30.51 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.12 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  30.96 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.4 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.07 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  30.6 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.97 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  31.17 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  30.54 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  31.12 
 
 		 444 aa  171  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  31.84 
 
 		 449 aa  171  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  28.73 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  30.19 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  30.9 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  30.02 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  29.45 
 
 		 472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.7 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  28 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  31.82 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  29.75 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  30.87 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  28.17 
 
 		 459 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  30.52 
 
 		 474 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  29.98 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.75 
 
 		 442 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  29.3 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  30.59 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  28.71 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  28.71 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  29.3 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  29.16 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  27.87 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  29.11 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  28.42 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  27.68 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  28.06 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  27.87 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  27.25 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  27.66 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  29.79 
 
 		 467 aa  153  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  30.35 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  29.88 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  26.79 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  30.13 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  26.92 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  29.96 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  30.16 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  29.96 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  30.16 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  27.23 
 
 		 489 aa  149  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  27.23 
 
 		 489 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  28.26 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  28.39 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  29.13 
 
 		 487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  27.52 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  28.57 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  27.78 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  28.9 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  29.44 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  28.33 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  27.92 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  27.92 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  28.63 
 
 		 449 aa  146  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  28.45 
 
 		 472 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  27.68 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  26.09 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.87 
 
 		 420 aa  143  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  26.93 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  28.6 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.68 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  27.25 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  27.87 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  26.92 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  27.85 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.83 
 
 		 442 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  26.28 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>