More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5637 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5637  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 495 aa  1016    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2145  allantoinase  63.48 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  32.39 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  33.91 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  33.48 
 
 		 442 aa  193  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  34.12 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.05 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  32.32 
 
 		 445 aa  191  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  33.19 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  32.9 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.76 
 
 		 445 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  32.31 
 
 		 445 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  32.62 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  33.4 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  31.44 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.47 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  33.77 
 
 		 446 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  32.7 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  32.04 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.47 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  31.67 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.44 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  33.84 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  33.41 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  29.72 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.43 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  33.26 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  30.98 
 
 		 444 aa  173  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  30.98 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  33.33 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  29.26 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  33.04 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  33.04 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  31.02 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.26 
 
 		 454 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  32.4 
 
 		 441 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  31.37 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.32 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.31 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  29.78 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.99 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  33.05 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  30.53 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.24 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  31.97 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  32.4 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.94 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  27.6 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.29 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  29.72 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  28.13 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.19 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  29.61 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  28.48 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  29.61 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  29.51 
 
 		 437 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  29.36 
 
 		 445 aa  156  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  27.88 
 
 		 440 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  29.72 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.08 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  26.15 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  32.26 
 
 		 439 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  27.66 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  26.28 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  27.63 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  29.47 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  29.25 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  26.49 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  28.73 
 
 		 428 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  28.24 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  28.99 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  28.99 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  25.73 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  28.99 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  27.19 
 
 		 426 aa  144  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  28.86 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  28.6 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  28.86 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  26.77 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  28.6 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  28.86 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  28.86 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  29.23 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  28.63 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  29.11 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.82 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  27.25 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  27.31 
 
 		 472 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  28.34 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  27.64 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  25.05 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.46 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  29.38 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  29.38 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  29.38 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  29.38 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  29.48 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  27.1 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  27.1 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  26.15 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>