More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1463 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  100 
 
 		 443 aa  915    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  100 
 
 		 443 aa  915    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  58.66 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  58.43 
 
 		 437 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  58.29 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  57.01 
 
 		 443 aa  505  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  57.14 
 
 		 440 aa  499  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  57.27 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  55.5 
 
 		 442 aa  471  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  52.93 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.07 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  44.98 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  42.82 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  44.5 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  44.34 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  43.67 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  42.76 
 
 		 444 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  42.76 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  42.76 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  44.8 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  44.12 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  42.73 
 
 		 444 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  42.79 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  42.2 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  42.79 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  42.43 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  42.79 
 
 		 446 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  42.66 
 
 		 444 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  42.95 
 
 		 445 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  42.55 
 
 		 442 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  42.48 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  43.66 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  43.54 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  43.36 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  44.75 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  43.75 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  42.73 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  43.05 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  43.05 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  40.69 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  43.05 
 
 		 456 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  43.76 
 
 		 445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  40.99 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  40.72 
 
 		 445 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  39.73 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  39.73 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  39.6 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  40.36 
 
 		 444 aa  309  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  40.52 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  38.43 
 
 		 448 aa  305  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  40.86 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  39.91 
 
 		 446 aa  299  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  40.77 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  39.42 
 
 		 449 aa  295  9e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  38.57 
 
 		 444 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  39.91 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  38.1 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  39.33 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  39.1 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  39.38 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  38.29 
 
 		 445 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.3 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  38.57 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  38.89 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  37.27 
 
 		 468 aa  272  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  37.3 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  33.73 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  35.23 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.37 
 
 		 494 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.14 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.31 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.9 
 
 		 418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.25 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.95 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  37.14 
 
 		 488 aa  229  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.76 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.54 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  34.97 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  32.64 
 
 		 430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  33.64 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.79 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  32.27 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.09 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  34.58 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  31.86 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  32.09 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  32.09 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  32.09 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.09 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.09 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.09 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  31.86 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  33.64 
 
 		 428 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.79 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.48 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.52 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.55 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.41 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.1 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>