More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0212 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  100 
 
 
423 aa  842    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  73.29 
 
 
488 aa  586  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  63.47 
 
 
440 aa  519  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  41.59 
 
 
468 aa  323  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  42.37 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  44.27 
 
 
432 aa  299  5e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.49 
 
 
422 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  37.05 
 
 
437 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  36.82 
 
 
437 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  36.15 
 
 
439 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.43 
 
 
399 aa  249  7e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  38.81 
 
 
442 aa  249  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  37.53 
 
 
440 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  36.94 
 
 
439 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  35.61 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  36.21 
 
 
440 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  38.92 
 
 
453 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  35.12 
 
 
469 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  37.97 
 
 
421 aa  229  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.22 
 
 
431 aa  229  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  37.88 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  35.75 
 
 
441 aa  226  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  36.91 
 
 
446 aa  225  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  36.02 
 
 
445 aa  225  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  37.32 
 
 
442 aa  225  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  35.34 
 
 
442 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  35.89 
 
 
445 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  40.31 
 
 
465 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  37.63 
 
 
444 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  37.14 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  40.42 
 
 
456 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  40.42 
 
 
456 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.75 
 
 
444 aa  222  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  36.69 
 
 
444 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.75 
 
 
444 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.51 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.24 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  40.21 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  38.81 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  36.78 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  36 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  35.44 
 
 
443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  35.44 
 
 
443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  32.48 
 
 
443 aa  219  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  36.61 
 
 
444 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  35.96 
 
 
453 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  36.12 
 
 
464 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  32.17 
 
 
446 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.16 
 
 
412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  37.12 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  36.12 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.09 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.41 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  31.97 
 
 
453 aa  212  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  33.8 
 
 
444 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.72 
 
 
426 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  39.24 
 
 
458 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  33.18 
 
 
446 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  34.73 
 
 
430 aa  210  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  36.57 
 
 
446 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  32.32 
 
 
445 aa  209  9e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.58 
 
 
444 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  32.56 
 
 
449 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.65 
 
 
418 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  32.7 
 
 
425 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  36.18 
 
 
448 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  32.79 
 
 
423 aa  203  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  36.25 
 
 
466 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  32.54 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  32.54 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  36.79 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  33.18 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  32.76 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.51 
 
 
428 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.51 
 
 
428 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.51 
 
 
428 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  32.51 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  32.51 
 
 
428 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  32.51 
 
 
428 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  32.51 
 
 
428 aa  199  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.27 
 
 
428 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.25 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  31.25 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  31.25 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  30.96 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  32.78 
 
 
425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  31.25 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  30.39 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.11 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.02 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.02 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.04 
 
 
420 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  31.41 
 
 
453 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  31.87 
 
 
453 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  35.66 
 
 
445 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  31.18 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  31.87 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  31.18 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  32.1 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.41 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>