More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06413 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  100 
 
 		 444 aa  927    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  56.73 
 
 		 444 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  55.01 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  54.99 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  54.99 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  54.34 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  52.68 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  53.39 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  53.19 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  53.19 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  51.34 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  50.56 
 
 		 448 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  51.57 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  50.33 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  51.68 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  51.38 
 
 		 446 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  48.74 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  49.31 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  48.55 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  50.12 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.72 
 
 		 442 aa  340  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  38.07 
 
 		 437 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  37.84 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  39.76 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  39.76 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  38.07 
 
 		 439 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.78 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  36.89 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.93 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  37.21 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  37.98 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  35.7 
 
 		 444 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  36.87 
 
 		 440 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  36.07 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  35.48 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  35.48 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  35.45 
 
 		 453 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  36.8 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  36.99 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  35.25 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  34.99 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.32 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  35.21 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  33.33 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.89 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  34.11 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  34.99 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  35.06 
 
 		 458 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.04 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.04 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.49 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  33.33 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  33.18 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  34.91 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  32.55 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  33.41 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  33.25 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  33.65 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  32.17 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.21 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  31.78 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.5 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  29.51 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  31.46 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  33.33 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  31 
 
 		 488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.24 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.92 
 
 		 494 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  29.59 
 
 		 449 aa  190  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  32 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  30.59 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  31.18 
 
 		 439 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  29.5 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  30.18 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  28.41 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  29.49 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.19 
 
 		 428 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  30.93 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  28.73 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  28.73 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  28.73 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  28.73 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.13 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  27.9 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  27.9 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.12 
 
 		 453 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  28.12 
 
 		 453 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  27.9 
 
 		 453 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  29.18 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  29.18 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.28 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  27.9 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  29.64 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.79 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.18 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  29.38 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  27.68 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  29.61 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.16 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  29.86 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>