More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2077 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  100 
 
 
440 aa  866    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  63.01 
 
 
423 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  60.5 
 
 
488 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  43.91 
 
 
468 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  39.82 
 
 
455 aa  312  9e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  42.72 
 
 
432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  39.67 
 
 
445 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.24 
 
 
422 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  40.28 
 
 
456 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  40.28 
 
 
456 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  37.91 
 
 
437 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  40.28 
 
 
456 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  37.68 
 
 
437 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  39.57 
 
 
421 aa  249  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  38.72 
 
 
440 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  39.26 
 
 
465 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  39.45 
 
 
453 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  37.96 
 
 
464 aa  240  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  37.83 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  41.31 
 
 
458 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 
421 aa  236  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  36.84 
 
 
444 aa  236  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  36.84 
 
 
444 aa  236  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.18 
 
 
442 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.28 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  36.83 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  36.59 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  36.84 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  38.19 
 
 
441 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  37.71 
 
 
442 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.3 
 
 
431 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  36.18 
 
 
446 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  37.18 
 
 
445 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  38.81 
 
 
443 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  38.81 
 
 
443 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  33.67 
 
 
443 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  37.02 
 
 
444 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.78 
 
 
418 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  37.12 
 
 
446 aa  226  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  37.39 
 
 
444 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  36.87 
 
 
444 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  36.97 
 
 
443 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  37.84 
 
 
446 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  35.94 
 
 
442 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  35.79 
 
 
469 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  37.41 
 
 
445 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.01 
 
 
418 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  38.54 
 
 
446 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  32.48 
 
 
418 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  36.81 
 
 
445 aa  222  9e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  33.41 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  35.75 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  36.82 
 
 
439 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  34.21 
 
 
441 aa  221  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  37.61 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  36.34 
 
 
439 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  37.02 
 
 
444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  33.33 
 
 
444 aa  216  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  33.95 
 
 
446 aa  216  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  36.47 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  33.95 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  33.9 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.24 
 
 
418 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  34.06 
 
 
449 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  33.18 
 
 
425 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  31.11 
 
 
453 aa  209  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  36.04 
 
 
442 aa  209  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  34.36 
 
 
428 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  34.6 
 
 
428 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.54 
 
 
420 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  35.32 
 
 
430 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  34.6 
 
 
428 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  34.6 
 
 
428 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  34.6 
 
 
428 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  34.36 
 
 
428 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  34.36 
 
 
428 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  34.36 
 
 
428 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  34.12 
 
 
428 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  34.36 
 
 
428 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  33.41 
 
 
453 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  35.51 
 
 
446 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  37.96 
 
 
439 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  34.58 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  33.18 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  35.89 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  33.33 
 
 
444 aa  199  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 
438 aa  199  9e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  33.57 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.74 
 
 
426 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  32.3 
 
 
447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  35.24 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  34.63 
 
 
448 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.6 
 
 
412 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  31.59 
 
 
425 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  31.59 
 
 
425 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  33.96 
 
 
428 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.01 
 
 
454 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  32.05 
 
 
425 aa  192  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  36.63 
 
 
445 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  31.83 
 
 
405 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>