More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1783 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  100 
 
 		 468 aa  960    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  63.86 
 
 		 455 aa  594  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  44.12 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  43.91 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  41.59 
 
 		 423 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  42.58 
 
 		 488 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  37.77 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  37.77 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.93 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  36.85 
 
 		 439 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  35.15 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  35.15 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  35.37 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  37.55 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  37.5 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  37.27 
 
 		 437 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  36.71 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  37.02 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  37.02 
 
 		 444 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.69 
 
 		 418 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  35.6 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.44 
 
 		 426 aa  249  6e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  35.83 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.87 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.68 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  35.25 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.41 
 
 		 399 aa  243  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  35.92 
 
 		 442 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  36.28 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  35.15 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  35.84 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  36.49 
 
 		 440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.9 
 
 		 431 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  34.76 
 
 		 440 aa  239  8e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  35.59 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  34.48 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.82 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  35.42 
 
 		 442 aa  237  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.53 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  35.81 
 
 		 446 aa  236  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  35.73 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  33.48 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  34.8 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.17 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  36.02 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  35.63 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.19 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  35.1 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.8 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  36.3 
 
 		 421 aa  229  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  33.77 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  35.79 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  34.96 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  34.47 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  34.63 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  34.09 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.64 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  35.35 
 
 		 446 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  32.74 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  36.5 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  33.78 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.94 
 
 		 425 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  33.56 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  33.56 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  33.56 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  33.56 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.87 
 
 		 425 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  33.56 
 
 		 428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  33.33 
 
 		 428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  33.56 
 
 		 428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  32.28 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  34.78 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  33.33 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  33.33 
 
 		 428 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  33.33 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  32.94 
 
 		 453 aa  212  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.48 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  35.31 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.65 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  31.65 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  31.65 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  31.65 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  34.91 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.97 
 
 		 454 aa  206  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  30.82 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  31.14 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  31.14 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  33.49 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.53 
 
 		 418 aa  204  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.52 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  31.14 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  31.14 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  31.14 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.87 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  34.11 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  31.14 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.39 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.37 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  30.92 
 
 		 453 aa  200  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.65 
 
 		 494 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>