More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0970 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  100 
 
 
488 aa  971    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  73.29 
 
 
423 aa  565  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  60.5 
 
 
440 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  42.31 
 
 
432 aa  318  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  42.58 
 
 
468 aa  309  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  39.44 
 
 
455 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  38.24 
 
 
440 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  37.53 
 
 
437 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  37.29 
 
 
437 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  39.39 
 
 
442 aa  257  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.08 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.38 
 
 
421 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  36.41 
 
 
439 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.99 
 
 
399 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  36.79 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  37.29 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.94 
 
 
431 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  36.38 
 
 
469 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.91 
 
 
418 aa  232  9e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  37.14 
 
 
442 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.77 
 
 
442 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  37.64 
 
 
443 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  37.64 
 
 
443 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  37.01 
 
 
444 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  36.79 
 
 
445 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.33 
 
 
412 aa  224  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  36.16 
 
 
445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  36.82 
 
 
440 aa  223  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  37.16 
 
 
465 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  37.2 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  37.2 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  37.35 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  36.82 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  38.37 
 
 
444 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  36.91 
 
 
464 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  32.35 
 
 
443 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  39.66 
 
 
421 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  37.12 
 
 
453 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  34.48 
 
 
441 aa  220  6e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  36.88 
 
 
442 aa  219  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  36.95 
 
 
446 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  37.32 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.73 
 
 
444 aa  217  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.73 
 
 
444 aa  217  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  35.89 
 
 
444 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  31.75 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  36.54 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  33.26 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  35.71 
 
 
453 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.3 
 
 
441 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  31.95 
 
 
453 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.95 
 
 
453 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  31.95 
 
 
453 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  35.98 
 
 
444 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  31.95 
 
 
453 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  36.13 
 
 
458 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  36.3 
 
 
446 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  36.88 
 
 
446 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  36.08 
 
 
446 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  37.53 
 
 
444 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  31.91 
 
 
445 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  32.63 
 
 
446 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  31.32 
 
 
446 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  33.02 
 
 
430 aa  205  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.54 
 
 
426 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  31.45 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  30.7 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  36.28 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.14 
 
 
457 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.41 
 
 
420 aa  199  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  35.24 
 
 
444 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  35.34 
 
 
448 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  31.03 
 
 
453 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.32 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.51 
 
 
418 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  33.88 
 
 
423 aa  196  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  32.48 
 
 
445 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.8 
 
 
453 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30.8 
 
 
453 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.8 
 
 
453 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.31 
 
 
418 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  30.8 
 
 
453 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  31.03 
 
 
453 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  32.55 
 
 
425 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  34.64 
 
 
459 aa  193  5e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  35.92 
 
 
429 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  35.97 
 
 
454 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  34.26 
 
 
445 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.87 
 
 
494 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.57 
 
 
453 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  35.8 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  35.23 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  35.87 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  30.31 
 
 
418 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  33.25 
 
 
444 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  28.92 
 
 
451 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  35.44 
 
 
445 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  32.75 
 
 
449 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.52 
 
 
428 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.68 
 
 
454 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>