More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4303 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  71.04 
 
 		 442 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  70.88 
 
 		 444 aa  651    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  93.23 
 
 		 446 aa  836    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  100 
 
 		 445 aa  898    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  69.91 
 
 		 444 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  70.72 
 
 		 444 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  82.84 
 
 		 446 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  70.88 
 
 		 444 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  71.04 
 
 		 444 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  98.43 
 
 		 445 aa  885    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  69.98 
 
 		 444 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  84.65 
 
 		 446 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  70.59 
 
 		 446 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  69.46 
 
 		 442 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  66.29 
 
 		 441 aa  628  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  72.17 
 
 		 444 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  68.33 
 
 		 444 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  69.18 
 
 		 440 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  68.1 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  64.79 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  63.66 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  61.38 
 
 		 441 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  60.18 
 
 		 444 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  57.21 
 
 		 453 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  57.82 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  58.16 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  58.16 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  57.47 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  57.53 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  50.11 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.07 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  53.22 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  44.53 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  44.27 
 
 		 437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  44.06 
 
 		 443 aa  338  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  42.86 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  43.76 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  43.76 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  42.47 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  41.4 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.24 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  40.05 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.84 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  37.33 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  38.46 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  39.37 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  35.96 
 
 		 444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  37.61 
 
 		 445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  38.84 
 
 		 449 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  38.58 
 
 		 449 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  37.9 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  33.93 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  35.4 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  34.15 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  36.43 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  37.33 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  36.51 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  37.61 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  33.18 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  36.71 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  37.93 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  36.19 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  33.25 
 
 		 444 aa  245  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  35.28 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  35.79 
 
 		 468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.03 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.24 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.92 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.29 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.38 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  35.79 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  32.16 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.54 
 
 		 488 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  33.26 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.75 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.05 
 
 		 420 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.12 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.81 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.86 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  36.12 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  29.72 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  34.66 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.57 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.39 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.19 
 
 		 448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  34.87 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.27 
 
 		 425 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.52 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 477 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.35 
 
 		 467 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.03 
 
 		 428 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.6 
 
 		 452 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5637  dihydropyrimidinase  32.31 
 
 		 495 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.14 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.14 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.14 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  30.64 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.95 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  30.22 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>