More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1448 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
399 aa  819    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  39.6 
 
 
432 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  37.95 
 
 
455 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  36.41 
 
 
468 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.99 
 
 
488 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  34.83 
 
 
440 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  35.95 
 
 
423 aa  229  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  35.01 
 
 
437 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  35.01 
 
 
437 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  35.31 
 
 
439 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  36.32 
 
 
442 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  35.19 
 
 
445 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  34.87 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.2 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  34.86 
 
 
445 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  34.35 
 
 
446 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  35.32 
 
 
444 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  34.76 
 
 
442 aa  209  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  33.49 
 
 
469 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  33.73 
 
 
439 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.42 
 
 
440 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.1 
 
 
431 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.37 
 
 
444 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.51 
 
 
422 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.42 
 
 
446 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  33.86 
 
 
443 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  34.94 
 
 
444 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  34.94 
 
 
444 aa  203  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  33.76 
 
 
441 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  33.03 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  34.53 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  33.42 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  33.42 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  33.42 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.26 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  33.74 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  33.82 
 
 
446 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  34.45 
 
 
444 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.78 
 
 
442 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  34.86 
 
 
445 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  33.5 
 
 
442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.01 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  33.18 
 
 
446 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.45 
 
 
431 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  34.94 
 
 
444 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  34.51 
 
 
418 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  33.8 
 
 
458 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  35.04 
 
 
465 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  35.19 
 
 
464 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  34.54 
 
 
444 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  32.47 
 
 
443 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  32.47 
 
 
443 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  32.77 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  32.31 
 
 
445 aa  186  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.93 
 
 
421 aa  186  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  34.96 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  35.32 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  33.18 
 
 
443 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  32.18 
 
 
446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  31.46 
 
 
453 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  30.57 
 
 
448 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  30.86 
 
 
446 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  34.4 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  34.4 
 
 
428 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  34.4 
 
 
428 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  34.4 
 
 
428 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  34.4 
 
 
428 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  32.64 
 
 
439 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  34.15 
 
 
428 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  34.15 
 
 
428 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  34.15 
 
 
428 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  34.4 
 
 
428 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  34.15 
 
 
428 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  33.02 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  31.85 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  30.65 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.97 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.59 
 
 
418 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  33.89 
 
 
428 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.53 
 
 
442 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  31.01 
 
 
439 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  29.34 
 
 
445 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  31.01 
 
 
445 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  30.15 
 
 
453 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  28.71 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.64 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  31.88 
 
 
430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  29.25 
 
 
449 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  29.25 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1675  amidohydrolase  34.42 
 
 
384 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.717756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  30.5 
 
 
449 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  29.09 
 
 
448 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  32.61 
 
 
425 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.27 
 
 
454 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  30.55 
 
 
445 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0660  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
398 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.7 
 
 
457 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  31.62 
 
 
449 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  32.37 
 
 
427 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.13 
 
 
426 aa  156  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>