More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1019 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
412 aa  831    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.55 
 
 
421 aa  474  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.24 
 
 
431 aa  471  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.14 
 
 
422 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  48.61 
 
 
421 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  37.82 
 
 
468 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  37.81 
 
 
432 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  39.33 
 
 
488 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.11 
 
 
455 aa  231  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.46 
 
 
399 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  36.87 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  36.6 
 
 
440 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  31.81 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  34.75 
 
 
453 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.73 
 
 
418 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.68 
 
 
418 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  33.57 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  31.85 
 
 
437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  31.85 
 
 
437 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.02 
 
 
420 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.08 
 
 
441 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.77 
 
 
444 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  31.33 
 
 
445 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  33.5 
 
 
446 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  33.25 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  32.45 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  33.09 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  33.74 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  32.43 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  32.56 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.5 
 
 
445 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  31.67 
 
 
439 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  32.3 
 
 
444 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.78 
 
 
446 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.71 
 
 
442 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  30.66 
 
 
441 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  35.16 
 
 
458 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  32.72 
 
 
442 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  33.68 
 
 
444 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.22 
 
 
457 aa  170  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.81 
 
 
431 aa  170  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  33.58 
 
 
446 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  35.07 
 
 
456 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  28.94 
 
 
443 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  35.07 
 
 
456 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  32.93 
 
 
445 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  32.46 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  34.62 
 
 
456 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.68 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.73 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  31.09 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  31.09 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  31.61 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.39 
 
 
440 aa  163  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.75 
 
 
431 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  33.74 
 
 
465 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.4 
 
 
426 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.15 
 
 
418 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  28.54 
 
 
446 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  33 
 
 
443 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.09 
 
 
494 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  32.92 
 
 
427 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  31.93 
 
 
436 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31.88 
 
 
427 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  32.32 
 
 
440 aa  156  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.43 
 
 
447 aa  156  6e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  30.63 
 
 
439 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.03 
 
 
454 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  31.45 
 
 
469 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.49 
 
 
425 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  32.34 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.3 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  32.11 
 
 
422 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1961  dihydroorotase  32.08 
 
 
383 aa  153  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.74 
 
 
429 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.39 
 
 
424 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  30.61 
 
 
425 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  31.16 
 
 
444 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.2 
 
 
425 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  30.38 
 
 
431 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1675  amidohydrolase  30.12 
 
 
384 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.717756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.5 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  32.56 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  30.83 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.9 
 
 
429 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  31.86 
 
 
428 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.45 
 
 
425 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  28.31 
 
 
448 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.29 
 
 
431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  32.11 
 
 
428 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.77 
 
 
425 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.32 
 
 
441 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  32.13 
 
 
428 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30.98 
 
 
428 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>