More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2703 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  82.13 
 
 		 444 aa  765    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  69.23 
 
 		 444 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  69.46 
 
 		 446 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  100 
 
 		 442 aa  905    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  82.35 
 
 		 444 aa  735    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  69 
 
 		 444 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  70.14 
 
 		 446 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  82.35 
 
 		 444 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  69.68 
 
 		 446 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  82.35 
 
 		 444 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  91.86 
 
 		 464 aa  846    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  69.23 
 
 		 442 aa  643    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  68.33 
 
 		 444 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  69.91 
 
 		 445 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  70.59 
 
 		 446 aa  656    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  69.48 
 
 		 440 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  83.26 
 
 		 444 aa  772    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  66.74 
 
 		 441 aa  630  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  69.46 
 
 		 445 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  65.61 
 
 		 445 aa  614  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  60.41 
 
 		 445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  61.76 
 
 		 444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  60.69 
 
 		 441 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  60.05 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  57.4 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  58.81 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  57.44 
 
 		 456 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  57.44 
 
 		 456 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  57.21 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.03 
 
 		 439 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  48.42 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  50.8 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  43.35 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  43.12 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  42.01 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  42.79 
 
 		 443 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  42.79 
 
 		 443 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.27 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  41.8 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  40.09 
 
 		 440 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  40.5 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  40.54 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  39.39 
 
 		 469 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  39.63 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  37.78 
 
 		 445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  36.73 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  35.06 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  35.15 
 
 		 444 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  34.89 
 
 		 453 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  36.61 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  35.75 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  35.44 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  34.23 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  38.05 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  35.14 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  35.04 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  34.68 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  33.33 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  34.68 
 
 		 449 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.85 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  35.92 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  32.88 
 
 		 444 aa  242  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.12 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  36.12 
 
 		 445 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  34.54 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  36.83 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  34.62 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.74 
 
 		 494 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  33.41 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.77 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  32.08 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  35.54 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.57 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.42 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.96 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  35.47 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  30 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  37.32 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.54 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.28 
 
 		 420 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  35.27 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  32.57 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  32.57 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  32.57 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  32.57 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.45 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  32.34 
 
 		 453 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.41 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  32.11 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  32.35 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  32.35 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  32.35 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  32.35 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.39 
 
 		 477 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.97 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  30.63 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.5 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  33.64 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  31.17 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.41 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>