More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0585 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00462  allantoinase  98.9 
 
 
453 aa  932    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  92.94 
 
 
453 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  98.45 
 
 
453 aa  929    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  92.94 
 
 
453 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  92.94 
 
 
453 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  98.9 
 
 
453 aa  932    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  100 
 
 
453 aa  939    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  99.78 
 
 
453 aa  937    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  98.45 
 
 
453 aa  929    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  92.94 
 
 
453 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  99.12 
 
 
453 aa  931    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  50.44 
 
 
458 aa  467  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.84 
 
 
454 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  42.7 
 
 
449 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  41.38 
 
 
448 aa  349  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  40.23 
 
 
461 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  40.18 
 
 
449 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  39.32 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  38.13 
 
 
449 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  35.62 
 
 
446 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  38.89 
 
 
476 aa  292  9e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  36.28 
 
 
443 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  34.51 
 
 
448 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  38.11 
 
 
450 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  35.25 
 
 
449 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  36.01 
 
 
455 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  36.89 
 
 
468 aa  276  8e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  36.53 
 
 
457 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  35.47 
 
 
452 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  35.09 
 
 
447 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.12 
 
 
457 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.98 
 
 
494 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  36.75 
 
 
473 aa  259  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  35.76 
 
 
442 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  34.55 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  38.58 
 
 
473 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  37.66 
 
 
569 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  33.72 
 
 
503 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  33.19 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  35.5 
 
 
453 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  32.39 
 
 
480 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  32.09 
 
 
470 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.17 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.06 
 
 
469 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  31.26 
 
 
481 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.36 
 
 
454 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  29.26 
 
 
453 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  31.54 
 
 
460 aa  206  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.57 
 
 
456 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.57 
 
 
456 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  31.22 
 
 
472 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  31.64 
 
 
432 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  33.41 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.25 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  31.76 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.11 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.39 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  30.28 
 
 
469 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  30.92 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.72 
 
 
464 aa  200  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.19 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  32.39 
 
 
453 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  31.28 
 
 
465 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  31.96 
 
 
444 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  31.06 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.11 
 
 
456 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  32.64 
 
 
441 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  29.83 
 
 
475 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  30.32 
 
 
444 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.44 
 
 
466 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  31.12 
 
 
444 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  29.91 
 
 
475 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  30.09 
 
 
444 aa  192  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  29.91 
 
 
475 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  29.91 
 
 
475 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  31.41 
 
 
478 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  31.36 
 
 
444 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  29.85 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  30.04 
 
 
444 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  31.89 
 
 
458 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  30.72 
 
 
472 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.05 
 
 
446 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  33.26 
 
 
439 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  30.06 
 
 
471 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  30.8 
 
 
488 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  30.77 
 
 
444 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  28.92 
 
 
442 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  29.03 
 
 
456 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  31.59 
 
 
446 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  30.32 
 
 
446 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.28 
 
 
444 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  29.22 
 
 
422 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  29.15 
 
 
474 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  30.14 
 
 
445 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  28.38 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  29.46 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  29.81 
 
 
473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  32.34 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  30.82 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.53 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>