More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3102 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  100 
 
 		 439 aa  894    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  68.49 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  62.79 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  54.46 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  53.29 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  51.03 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  52.98 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  52.74 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  51.03 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  51.03 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  52.87 
 
 		 444 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  50.8 
 
 		 444 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  51.26 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  50.34 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  51.03 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  51.03 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  50.57 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  50.57 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  51.03 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  51.03 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  51.37 
 
 		 456 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  51.61 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  51.4 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  51.49 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  53.96 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  51.26 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  51.03 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  48.51 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  50.84 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  50.34 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  51.07 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  51.07 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  40.69 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  40.69 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.52 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  37.38 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  36.01 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  37.38 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  38.63 
 
 		 442 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  35.62 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  36.93 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  36.75 
 
 		 440 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  35.06 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  34.43 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  33.41 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  32.77 
 
 		 443 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  31.15 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  34.59 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  30.25 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  31.34 
 
 		 446 aa  226  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  34.09 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  32.61 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  28.76 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  32.16 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  33.64 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.21 
 
 		 455 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  36.82 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  31.95 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  30.36 
 
 		 449 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  33.17 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.41 
 
 		 418 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  33.91 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  33.64 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  30.73 
 
 		 449 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.64 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  30.96 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  28.22 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  34.1 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.25 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.42 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  29.5 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.05 
 
 		 488 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.01 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  33.26 
 
 		 453 aa  192  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  33.04 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  33.04 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  33.04 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  33.26 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  32.82 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  36.79 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.22 
 
 		 494 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  33.26 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  30.97 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  33.26 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.4 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  30.4 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.66 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  32.13 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  32.13 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  32.13 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  32.13 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.35 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  34.1 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  31.71 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  29.4 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  32.87 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.77 
 
 		 432 aa  180  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5637  dihydropyrimidinase  32.7 
 
 		 495 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  32.43 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>