More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0610 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  100 
 
 		 445 aa  927    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  62.92 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  61.12 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  57.6 
 
 		 443 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  57.11 
 
 		 444 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  55.73 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  54.5 
 
 		 445 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  54.89 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  53.57 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  52.91 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  52.2 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  52 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  51.57 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  51.67 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  51.45 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  50.45 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  48.76 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  48.31 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  47.96 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  47.18 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.59 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  42.89 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  42.89 
 
 		 437 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  42.4 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  40.59 
 
 		 439 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  42.4 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  41.08 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  40.99 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  40.99 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  40.99 
 
 		 442 aa  295  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.77 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  38.15 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  37.16 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  37.16 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  37.84 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  37.78 
 
 		 442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  37.84 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  36.94 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  37.02 
 
 		 456 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  36.73 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  37.02 
 
 		 456 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  37.92 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  34.76 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  35.07 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  37.39 
 
 		 446 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  36.43 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  37.22 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  35.83 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  36.88 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  36.26 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  36.79 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  37.08 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  37.61 
 
 		 445 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  38.57 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  36.55 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  35.44 
 
 		 465 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  35.81 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  34.83 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  33.71 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  33.78 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.38 
 
 		 418 aa  246  8e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  30.25 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  32.22 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  31.1 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.51 
 
 		 449 aa  223  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  31.91 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  34.23 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  31.69 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  31.91 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  33.26 
 
 		 430 aa  203  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  30.77 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  31.97 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  32.22 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33 
 
 		 494 aa  199  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.37 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.24 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.08 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  33.33 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  32.32 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.12 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  32.58 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.41 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  32.41 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.61 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  30.54 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  30.54 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  32.49 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  29.33 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  28.99 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  30.82 
 
 		 425 aa  180  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  31.67 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.56 
 
 		 426 aa  179  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  31.22 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  30.14 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30.94 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  30.84 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.95 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  31.22 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.9 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  30.95 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>