More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0919 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  100 
 
 		 449 aa  931    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  56.63 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  54.93 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  54.81 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  54.89 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  54.94 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  54.69 
 
 		 446 aa  481  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  51.9 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  52.74 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  50.23 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  52.01 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  51.86 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  49.56 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  51.88 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  48.55 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  52.33 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  51.01 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  50.22 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  50.22 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  48.78 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.44 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  38.57 
 
 		 440 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  40.1 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  40.1 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  37.99 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  36.87 
 
 		 443 aa  270  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  36.55 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  36.55 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  36.18 
 
 		 439 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  37.23 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  37.63 
 
 		 441 aa  258  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  38.73 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  35.48 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  34.38 
 
 		 453 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  35.21 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  35.21 
 
 		 444 aa  249  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  35.09 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  35.48 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  37.69 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.33 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  34.96 
 
 		 465 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.83 
 
 		 440 aa  246  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  35.22 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  34.74 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  35.12 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  37.11 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  34.68 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  36.86 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  36.86 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.94 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.47 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.47 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  35.28 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  34.76 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  36.44 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  33.41 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  33.87 
 
 		 446 aa  236  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  34.54 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.52 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.08 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  34.58 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  34.14 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  33.26 
 
 		 488 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  33.17 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.39 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  30.71 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  31.94 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.06 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  30.2 
 
 		 455 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.68 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.15 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  32.6 
 
 		 439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.63 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.07 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  31.92 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  30.28 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.22 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.34 
 
 		 418 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.29 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  30 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.85 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  30.3 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  29.95 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.62 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.92 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  29.46 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  28.51 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.24 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  30.89 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 431 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.29 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  30.1 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  30.75 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  28.83 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  30.66 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.35 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  27.63 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  27.63 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  27.63 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  27.63 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>