More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1889 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  100 
 
 		 444 aa  929    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  56.31 
 
 		 444 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  56.73 
 
 		 444 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  53.48 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  53.6 
 
 		 443 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  54.04 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  54.12 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  53.72 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  52.91 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  51.46 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  52.89 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  51.91 
 
 		 445 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  53.11 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  53.11 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  52.91 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  53.03 
 
 		 445 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  51.55 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  50.91 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  51.12 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  51.9 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.6 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  40.09 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  40.09 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  38.69 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  40.04 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  38.6 
 
 		 439 aa  289  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  38.55 
 
 		 440 aa  283  6.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  38.1 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  38.1 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  36.26 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  34.65 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  35.06 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  34.69 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  34.69 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  37.21 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  35.38 
 
 		 469 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  34.84 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  36.95 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  36.95 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.41 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  34.75 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  37.74 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  33.18 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.51 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  33.33 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.09 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  34.31 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  33.56 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  34.38 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.88 
 
 		 442 aa  242  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  33.41 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  34.43 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.65 
 
 		 464 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.82 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.81 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  33.11 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.67 
 
 		 442 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  32.35 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.29 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  33.42 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.71 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  33.42 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  31.1 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.23 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  33.02 
 
 		 442 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  33.49 
 
 		 439 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  33.26 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  30.63 
 
 		 418 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.75 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.11 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  31.82 
 
 		 425 aa  189  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.53 
 
 		 494 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.43 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  31.16 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  29.35 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  31.35 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  30.34 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  29.66 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  29.26 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  28.38 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.68 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  30.3 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  30.98 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.48 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  28.57 
 
 		 455 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  29.13 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  30.45 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  29.13 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  30.77 
 
 		 488 aa  170  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  29.75 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.23 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  30.73 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.1 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  29.1 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.71 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  31.72 
 
 		 423 aa  166  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.64 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  29.04 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.03 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  28.67 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>