More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4820 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  71.11 
 
 		 444 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  69.68 
 
 		 442 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  71.11 
 
 		 444 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  93.91 
 
 		 445 aa  840    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  69.75 
 
 		 444 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  71.3 
 
 		 446 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  70.05 
 
 		 444 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  71.85 
 
 		 444 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  84.46 
 
 		 446 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  100 
 
 		 446 aa  893    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  93.23 
 
 		 445 aa  815    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  83.18 
 
 		 446 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  71.49 
 
 		 444 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  71.49 
 
 		 442 aa  646    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  70.32 
 
 		 440 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  66.97 
 
 		 441 aa  628  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  71.72 
 
 		 444 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  68.78 
 
 		 444 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  68.33 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  65.01 
 
 		 445 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  63.66 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  61.61 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  61.31 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  56.76 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  57.14 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  58.62 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  58.62 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  58.39 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  58.45 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  54.42 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.07 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  49.66 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  41.91 
 
 		 443 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  41.74 
 
 		 437 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  43.06 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  41.51 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  42.18 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.17 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  41.4 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  43.36 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  43.36 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  39.14 
 
 		 440 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  38.2 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  36.28 
 
 		 443 aa  293  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  37.84 
 
 		 445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  35.67 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  39.14 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  36.77 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  34.38 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  38.17 
 
 		 449 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  35.84 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  34.89 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  36.43 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  37.56 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  37.33 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  38.25 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  37.39 
 
 		 445 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  36.22 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  32.51 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  36.04 
 
 		 445 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  37.01 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  33.18 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  34.76 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  35.35 
 
 		 445 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.06 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.96 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  32.63 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.8 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  35.35 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.84 
 
 		 440 aa  222  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.52 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  33.56 
 
 		 455 aa  219  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.7 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.05 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.89 
 
 		 488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.81 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  34.39 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  36.91 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.35 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  30.48 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.63 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.87 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  33.71 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.42 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.44 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  33.55 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  30.25 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.28 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  30.98 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.28 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  30.98 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  30.98 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.28 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  30.98 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  30.5 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30.28 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  30.56 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  30.98 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  30.05 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>