More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0320 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  89.28 
 
 
456 aa  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  100 
 
 
458 aa  922    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  76.07 
 
 
465 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  88.84 
 
 
456 aa  791    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  88.84 
 
 
456 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  61.61 
 
 
453 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  58.81 
 
 
442 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  61.56 
 
 
446 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  58.81 
 
 
464 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  58.9 
 
 
444 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  59.04 
 
 
444 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  59.27 
 
 
444 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  60.05 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  59.73 
 
 
444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  59.17 
 
 
440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  58.81 
 
 
444 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  57.76 
 
 
442 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  57.76 
 
 
445 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  58.45 
 
 
446 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  58.22 
 
 
446 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  57.53 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  55.02 
 
 
445 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  55.94 
 
 
444 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  55.94 
 
 
444 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  53.2 
 
 
441 aa  486  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  55.25 
 
 
444 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  54.46 
 
 
445 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  56.06 
 
 
444 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  55.17 
 
 
441 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.49 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  54.23 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  51.83 
 
 
442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  45.64 
 
 
437 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  45.64 
 
 
437 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.14 
 
 
442 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  45.08 
 
 
439 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  44.85 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  43.84 
 
 
440 aa  354  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  43.28 
 
 
443 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  45.21 
 
 
443 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  45.21 
 
 
443 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  44.77 
 
 
442 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  41.88 
 
 
469 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  38.52 
 
 
443 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  39.8 
 
 
446 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  37.56 
 
 
453 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  37.08 
 
 
445 aa  289  8e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  37.39 
 
 
445 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  36.48 
 
 
446 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  35.58 
 
 
448 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  38.05 
 
 
449 aa  277  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  38.05 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  37.3 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  37.03 
 
 
453 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  38.05 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  36.3 
 
 
444 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  36.2 
 
 
468 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  34.27 
 
 
444 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  34.39 
 
 
444 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  35.89 
 
 
446 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  39.26 
 
 
432 aa  249  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  35.59 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  40.42 
 
 
440 aa  243  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  36.43 
 
 
445 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  37.33 
 
 
445 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.91 
 
 
457 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.72 
 
 
418 aa  236  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.84 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.68 
 
 
494 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  36.28 
 
 
445 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  37.25 
 
 
449 aa  230  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  36.18 
 
 
461 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  31.53 
 
 
405 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.07 
 
 
418 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  32.81 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.85 
 
 
488 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  29.84 
 
 
418 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.97 
 
 
420 aa  209  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  33.49 
 
 
453 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  33.49 
 
 
453 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  33.49 
 
 
453 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  33.49 
 
 
453 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  37.43 
 
 
423 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.21 
 
 
418 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  37 
 
 
454 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  34.75 
 
 
448 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.84 
 
 
426 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  36.24 
 
 
444 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  32.8 
 
 
453 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  32.8 
 
 
453 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  32.8 
 
 
453 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  32.8 
 
 
453 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.2 
 
 
399 aa  202  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  32.11 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.46 
 
 
425 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.35 
 
 
453 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  31.88 
 
 
453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  34.57 
 
 
466 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.48 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  32.06 
 
 
462 aa  197  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>