More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0692 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  83.18 
 
 		 446 aa  749    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  71.92 
 
 		 440 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  71.08 
 
 		 446 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  71.01 
 
 		 444 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  71.01 
 
 		 444 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  83.3 
 
 		 445 aa  747    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  69.46 
 
 		 442 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  91.01 
 
 		 446 aa  830    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  82.84 
 
 		 445 aa  733    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  68.47 
 
 		 444 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  70.5 
 
 		 444 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  100 
 
 		 446 aa  896    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  71.72 
 
 		 442 aa  650    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  71.91 
 
 		 444 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  70.81 
 
 		 444 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  68.78 
 
 		 441 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  68.55 
 
 		 444 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  71.49 
 
 		 444 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  68.78 
 
 		 464 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  65.46 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  64.79 
 
 		 445 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  63.35 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  63.76 
 
 		 441 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  59.18 
 
 		 465 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  56.53 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  60.05 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  59.08 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  59.08 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  58.62 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.03 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  53.33 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  47.64 
 
 		 442 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  43.35 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  43.12 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  42.14 
 
 		 439 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  41.8 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.4 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  42.02 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  43.54 
 
 		 443 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  43.54 
 
 		 443 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  41.18 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  39.82 
 
 		 440 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  39.11 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  39.49 
 
 		 446 aa  299  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  34.83 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  39.1 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  36.6 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  35.6 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  37.78 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  35.62 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  35.59 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  36.55 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  38.55 
 
 		 449 aa  266  8e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  38.1 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  35.06 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  39.55 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  38.69 
 
 		 449 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.37 
 
 		 457 aa  259  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  37.14 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  39.24 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.05 
 
 		 494 aa  255  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  38.65 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  37.67 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  36.59 
 
 		 448 aa  252  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  34.04 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  36.49 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  34.47 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.41 
 
 		 431 aa  237  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.32 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.92 
 
 		 455 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.15 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  32.24 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  34.97 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.75 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  37.9 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.67 
 
 		 418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  35.98 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  34.37 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  35.85 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  38.9 
 
 		 423 aa  202  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  33.26 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.67 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.82 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  30.89 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.35 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  30.75 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  32.16 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.42 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  32.16 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  32.16 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  32.16 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.57 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  34.91 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.57 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.7 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.57 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.57 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.05 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.26 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.35 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>