More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1836 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  66.39 
 
 		 481 aa  649    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  65.84 
 
 		 485 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  69.67 
 
 		 480 aa  727    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  65.22 
 
 		 483 aa  693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  86.22 
 
 		 479 aa  885    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  65.63 
 
 		 485 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  94.36 
 
 		 496 aa  952    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  66.26 
 
 		 483 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  66.24 
 
 		 473 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  65.84 
 
 		 485 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  89.98 
 
 		 499 aa  913    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  64.39 
 
 		 483 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  66.05 
 
 		 485 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  90.4 
 
 		 479 aa  916    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  65.42 
 
 		 486 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  65.84 
 
 		 485 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  96.45 
 
 		 479 aa  966    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  100 
 
 		 479 aa  994    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  66.05 
 
 		 485 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  68.05 
 
 		 486 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  67.78 
 
 		 481 aa  703    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  68.33 
 
 		 483 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  66.05 
 
 		 485 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  62.18 
 
 		 478 aa  615  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  62.53 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  54.7 
 
 		 485 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  54.49 
 
 		 484 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  53.65 
 
 		 484 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  54.91 
 
 		 483 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  54.28 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  53.03 
 
 		 484 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  53.24 
 
 		 484 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  52.82 
 
 		 484 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  54.91 
 
 		 483 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  53.14 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  54.91 
 
 		 501 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  53.14 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  54.19 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  52.19 
 
 		 484 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  53.01 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  50.52 
 
 		 487 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  46.09 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  43.96 
 
 		 475 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  43.38 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  43.48 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  45.51 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  42.54 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  41.96 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  41.87 
 
 		 475 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  41.87 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  41.87 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  44.44 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  42.39 
 
 		 469 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  39.13 
 
 		 464 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  41.33 
 
 		 471 aa  339  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  42.12 
 
 		 472 aa  339  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  39.62 
 
 		 478 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  37.36 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  39.62 
 
 		 479 aa  312  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  35.57 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  38.89 
 
 		 472 aa  310  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  37.66 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  36.05 
 
 		 461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  36.27 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  36.27 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  36.05 
 
 		 461 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  37.29 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  38.2 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  37.55 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  36.65 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  38.54 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  37.17 
 
 		 477 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  38.79 
 
 		 451 aa  295  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  37.64 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  37.06 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  37.28 
 
 		 471 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  37.28 
 
 		 471 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  33.89 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  38.85 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  37.39 
 
 		 472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  37.31 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  37.31 
 
 		 478 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  36.56 
 
 		 473 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  34.07 
 
 		 451 aa  279  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  37.47 
 
 		 475 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  38.54 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  35.06 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  36.23 
 
 		 489 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  34.06 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  35.12 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  33.84 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  33.84 
 
 		 485 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  33.98 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  38 
 
 		 503 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  33.91 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>