More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0732 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  64.33 
 
 		 484 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  67.3 
 
 		 475 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  67.93 
 
 		 478 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 479 aa  988    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  63.51 
 
 		 484 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  62.2 
 
 		 471 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  61.86 
 
 		 472 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  61.73 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  61.3 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  61.3 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  57.42 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  54.7 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  56.47 
 
 		 466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  55 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  55.16 
 
 		 475 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  54.19 
 
 		 477 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  48.19 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  48.19 
 
 		 485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  48.4 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  47.03 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  45.27 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  47.93 
 
 		 503 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  46.07 
 
 		 472 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  45.99 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  46.95 
 
 		 489 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  43.17 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  42.48 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  43.89 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  42.08 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  42.46 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  39.74 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  39.52 
 
 		 475 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  39.52 
 
 		 475 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  39.52 
 
 		 475 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  40.52 
 
 		 489 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  40.52 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  40.85 
 
 		 473 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  43.34 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  39.57 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  40.35 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  38.81 
 
 		 472 aa  318  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  40.31 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  39.09 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  39.26 
 
 		 484 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  39.87 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  39.31 
 
 		 484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  38.68 
 
 		 471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  39.87 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  40.34 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  39.91 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  39.91 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  39.91 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  39.91 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  40.76 
 
 		 501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  40.3 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  39.91 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  38.31 
 
 		 484 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  39.91 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  38.48 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  39.13 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  39.7 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  41.3 
 
 		 475 aa  306  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  38.92 
 
 		 485 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  38.61 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  38.04 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  39.37 
 
 		 478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  37.55 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  37.12 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  41.74 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  37 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  37.47 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  38.74 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  39.14 
 
 		 478 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  37.47 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  36.82 
 
 		 479 aa  293  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  37.15 
 
 		 483 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  36.32 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  36.32 
 
 		 479 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  38.85 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  36.58 
 
 		 489 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  36.73 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  37.5 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  36.89 
 
 		 451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  36.01 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  37.47 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  36.91 
 
 		 485 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  36.91 
 
 		 485 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  37.34 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  37.96 
 
 		 481 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  36.48 
 
 		 485 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  34.67 
 
 		 474 aa  276  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  35.84 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  34.92 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  33.69 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  35.83 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  38.26 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  36.62 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  36.27 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>