More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0358 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 483 aa  978    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  56.99 
 
 		 470 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4086  amidohydrolase  46.01 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3519  dihydropyrimidinase  42.13 
 
 		 488 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  37.63 
 
 		 479 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  37.19 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  29.94 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  32.17 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  33.07 
 
 		 466 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.34 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  30.6 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  30.6 
 
 		 489 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  28.51 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  29.8 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.93 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.68 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.14 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  29.69 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  30.15 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1058  amidohydrolase  29.35 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  28.83 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.58 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  29.24 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  30.82 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  31.54 
 
 		 478 aa  176  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  30 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.94 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  29.14 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  28.71 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  30.44 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  29.23 
 
 		 456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  31.3 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  29.88 
 
 		 477 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  29.48 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  26.64 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  29.48 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  28.11 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  31.5 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  29.04 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.61 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  28.71 
 
 		 484 aa  170  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  28.25 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  29.84 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  27.97 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  28.28 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  28.51 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.19 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  27.16 
 
 		 481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  27.78 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  31.24 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  30.94 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  31.16 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  28.66 
 
 		 479 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  29.46 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  28.51 
 
 		 484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  30.96 
 
 		 461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  29.52 
 
 		 501 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  29.18 
 
 		 464 aa  166  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  28.6 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2544  amidohydrolase  29.74 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  28.66 
 
 		 499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  27.85 
 
 		 483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  28.8 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  28.92 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  28.26 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  29.44 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  27.24 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.18 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  29.19 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  28.43 
 
 		 475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  28.69 
 
 		 473 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  28.57 
 
 		 485 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  28.57 
 
 		 485 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  28.75 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  31.73 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  30.27 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  29.04 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  28.69 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  32.11 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  28.48 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  28.88 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  28.66 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  28.02 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  28.37 
 
 		 485 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  29.09 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  28.66 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  31.52 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  28.36 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  29.46 
 
 		 527 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  30.96 
 
 		 462 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  31.32 
 
 		 485 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  29.2 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  30.36 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  28.66 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  28.16 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  28.33 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  28.16 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  28.66 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.45 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  28.16 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>