More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6635 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  100 
 
 
470 aa  955    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  56.99 
 
 
483 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4086  amidohydrolase  43.35 
 
 
488 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3519  dihydropyrimidinase  39.75 
 
 
488 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  37.89 
 
 
463 aa  263  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  35.18 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  31.45 
 
 
448 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  31.58 
 
 
474 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.31 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  33.2 
 
 
477 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  31.3 
 
 
466 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  30.18 
 
 
472 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  26.96 
 
 
464 aa  190  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  28.11 
 
 
464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  32.24 
 
 
475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  29.61 
 
 
474 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  30.63 
 
 
479 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  32.14 
 
 
501 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  32.14 
 
 
483 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  31.9 
 
 
461 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  29.26 
 
 
474 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  31.31 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  33.26 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  31.58 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.34 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  31.93 
 
 
483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  31.65 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  30.63 
 
 
485 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1058  amidohydrolase  29.01 
 
 
499 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.49 
 
 
456 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  30.83 
 
 
485 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.49 
 
 
456 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  28.42 
 
 
460 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  30.64 
 
 
485 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  31.16 
 
 
484 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  31.96 
 
 
451 aa  172  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  30.35 
 
 
464 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  27.97 
 
 
449 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  30.43 
 
 
485 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  30.52 
 
 
484 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  31.98 
 
 
478 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.85 
 
 
454 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  30.51 
 
 
472 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.98 
 
 
457 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  28.51 
 
 
479 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  29.9 
 
 
489 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  28.89 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  29.52 
 
 
459 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.93 
 
 
454 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  30.78 
 
 
484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  29.69 
 
 
489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.62 
 
 
458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  29.04 
 
 
477 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  31.51 
 
 
483 aa  166  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.08 
 
 
494 aa  166  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08418  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 
527 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  26.3 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  30.3 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  30.12 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  29.6 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  28.31 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  28.89 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  30.33 
 
 
442 aa  163  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  28.31 
 
 
479 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  30.59 
 
 
484 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  30.91 
 
 
461 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  30.38 
 
 
484 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  31.29 
 
 
467 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  28.88 
 
 
453 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  27.87 
 
 
457 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  28.31 
 
 
499 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  29.71 
 
 
471 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  29.18 
 
 
484 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  30 
 
 
484 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  28.88 
 
 
453 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.88 
 
 
453 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  28.11 
 
 
479 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  29.26 
 
 
444 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  28.88 
 
 
453 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  29.06 
 
 
473 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  28.88 
 
 
453 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  29.98 
 
 
483 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  28.67 
 
 
453 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  28.37 
 
 
481 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  29.73 
 
 
471 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  29.73 
 
 
471 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  29.19 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  28.45 
 
 
453 aa  156  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  28.95 
 
 
469 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  30.88 
 
 
441 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  29.61 
 
 
478 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  28.23 
 
 
453 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  28.46 
 
 
502 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  28.23 
 
 
453 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  28.22 
 
 
475 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  28.23 
 
 
453 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  28.23 
 
 
453 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  29.77 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  30.08 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  28.81 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>