More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1058 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  82.11 
 
 
502 aa  852    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1058  amidohydrolase  100 
 
 
499 aa  1029    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  32.75 
 
 
448 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  29.06 
 
 
464 aa  206  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  29 
 
 
474 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  30.21 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  31.35 
 
 
479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  28.68 
 
 
474 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  29.35 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.4 
 
 
457 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  29.55 
 
 
446 aa  171  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  29.01 
 
 
470 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  27.53 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  27.76 
 
 
454 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.27 
 
 
494 aa  160  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  27.18 
 
 
472 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  29.34 
 
 
465 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  27.1 
 
 
473 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  30.43 
 
 
460 aa  154  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  28.43 
 
 
459 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  26.38 
 
 
469 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  28.19 
 
 
444 aa  150  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  29.22 
 
 
446 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  25.79 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  28.19 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  25.79 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  25.79 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  27.6 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  28.25 
 
 
442 aa  147  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  27.25 
 
 
444 aa  146  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  25.86 
 
 
460 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  27.5 
 
 
489 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  27.88 
 
 
477 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  26.6 
 
 
474 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  27.9 
 
 
440 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  27.11 
 
 
471 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  25.79 
 
 
471 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  25.79 
 
 
471 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  27.79 
 
 
467 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  26.91 
 
 
441 aa  144  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  28.51 
 
 
442 aa  143  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  28.45 
 
 
453 aa  143  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  26.67 
 
 
459 aa  143  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  28.03 
 
 
464 aa  143  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  27.93 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  28.16 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  28.25 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  27.93 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  30.91 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  28.23 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  28.45 
 
 
453 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  27.93 
 
 
456 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  28.45 
 
 
453 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  28.04 
 
 
453 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  27.59 
 
 
444 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  27.66 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  28.25 
 
 
453 aa  140  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.04 
 
 
453 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  26.56 
 
 
473 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  28.12 
 
 
458 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  26.82 
 
 
470 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  29.33 
 
 
449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  26.98 
 
 
479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  26.99 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  27.16 
 
 
480 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  28.17 
 
 
475 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  25.25 
 
 
472 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  27.76 
 
 
446 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  29.09 
 
 
446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  28.24 
 
 
464 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  27.63 
 
 
453 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  27.63 
 
 
453 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  27.63 
 
 
453 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  27.63 
 
 
453 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  29.05 
 
 
453 aa  136  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  26.72 
 
 
475 aa  136  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  27.8 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  26.1 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  27.87 
 
 
439 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  27.55 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  25.21 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  27.45 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  26.48 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  27.74 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  26.57 
 
 
479 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  27.46 
 
 
478 aa  133  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  25.75 
 
 
458 aa  133  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  26.11 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  25.51 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  25.41 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  26.56 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  26.32 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  27.18 
 
 
445 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  24.65 
 
 
483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  27.08 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  24.9 
 
 
483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  24.8 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  25.96 
 
 
479 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  24.1 
 
 
451 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  26.57 
 
 
499 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>