More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1099 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  100 
 
 
463 aa  948    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  37.19 
 
 
483 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  37.89 
 
 
470 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  32.64 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  36.01 
 
 
448 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  32.22 
 
 
464 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  31.5 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  33.47 
 
 
477 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  32.1 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  31.57 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  32.29 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  31.51 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  31.47 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  31.3 
 
 
484 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  31.66 
 
 
484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  32.73 
 
 
489 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  31.08 
 
 
474 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.7 
 
 
454 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  31.36 
 
 
451 aa  193  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  31.51 
 
 
484 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  30.61 
 
 
475 aa  193  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  31.77 
 
 
474 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  31.26 
 
 
484 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  31.3 
 
 
483 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  30.74 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  31.28 
 
 
502 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.19 
 
 
457 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
494 aa  190  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  31.3 
 
 
483 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  30.32 
 
 
489 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  31.3 
 
 
501 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  30.53 
 
 
489 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4086  amidohydrolase  31.92 
 
 
488 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  30.25 
 
 
484 aa  186  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  31.01 
 
 
469 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  29.98 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  31.73 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  31.13 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1058  amidohydrolase  30.21 
 
 
499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.75 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.75 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  31.38 
 
 
483 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  30.19 
 
 
479 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  31.06 
 
 
484 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  30.83 
 
 
459 aa  181  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  30.46 
 
 
485 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  30.21 
 
 
467 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  32.02 
 
 
485 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  30 
 
 
481 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  31.68 
 
 
485 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  30.93 
 
 
471 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.32 
 
 
456 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  30.93 
 
 
471 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  29.35 
 
 
489 aa  177  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  29.22 
 
 
464 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  31.47 
 
 
485 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  28.78 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  29.83 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  30.14 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  28.57 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  29.71 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  30.66 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  28.96 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  28.57 
 
 
496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  29.77 
 
 
499 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  29.34 
 
 
489 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  27.94 
 
 
479 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  31.62 
 
 
460 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  29.7 
 
 
446 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  30.22 
 
 
444 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  29.72 
 
 
479 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  29.79 
 
 
487 aa  169  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  29.84 
 
 
471 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  28.57 
 
 
452 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  30.74 
 
 
459 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  29.24 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  31.4 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  29.42 
 
 
485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  31.12 
 
 
442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  28.75 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  29.4 
 
 
485 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  28.63 
 
 
485 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  29.22 
 
 
485 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  29.94 
 
 
481 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  29.22 
 
 
485 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  29.79 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  29.01 
 
 
485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  31.97 
 
 
458 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  28.54 
 
 
461 aa  163  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  29.45 
 
 
473 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  28.33 
 
 
465 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  29.04 
 
 
472 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  28.33 
 
 
465 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  28.33 
 
 
461 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  28.33 
 
 
461 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  28.33 
 
 
461 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  28.33 
 
 
461 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  28.66 
 
 
483 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  29.01 
 
 
485 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  29.38 
 
 
479 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>